Protein–RNA interactions for Protein: P62965

Crabp1, Cellular retinoic acid-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 137 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Crabp1P62965 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Crabp1P62965 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Crabp1P62965 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Crabp1P62965 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Crabp1P62965 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Crabp1P62965 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Crabp1P62965 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Crabp1P62965 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Crabp1P62965 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Crabp1P62965 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Crabp1P62965 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Crabp1P62965 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Crabp1P62965 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Crabp1P62965 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Crabp1P62965 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Crabp1P62965 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Crabp1P62965 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Crabp1P62965 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Crabp1P62965 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Crabp1P62965 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Crabp1P62965 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Crabp1P62965 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Crabp1P62965 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Crabp1P62965 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Crabp1P62965 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Crabp1P62965 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Crabp1P62965 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Crabp1P62965 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Crabp1P62965 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Crabp1P62965 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Crabp1P62965 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Crabp1P62965 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Crabp1P62965 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Crabp1P62965 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Crabp1P62965 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Crabp1P62965 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Crabp1P62965 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Crabp1P62965 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Crabp1P62965 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Crabp1P62965 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Crabp1P62965 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Crabp1P62965 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Crabp1P62965 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Crabp1P62965 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Crabp1P62965 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Crabp1P62965 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Crabp1P62965 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Crabp1P62965 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Crabp1P62965 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Crabp1P62965 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Crabp1P62965 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Crabp1P62965 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Crabp1P62965 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Crabp1P62965 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Crabp1P62965 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Crabp1P62965 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Crabp1P62965 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Crabp1P62965 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Crabp1P62965 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Crabp1P62965 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Crabp1P62965 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Crabp1P62965 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Crabp1P62965 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Crabp1P62965 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Crabp1P62965 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Crabp1P62965 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Crabp1P62965 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Crabp1P62965 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Crabp1P62965 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Crabp1P62965 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Crabp1P62965 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
Crabp1P62965 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Crabp1P62965 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Crabp1P62965 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Crabp1P62965 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
Crabp1P62965 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Crabp1P62965 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Crabp1P62965 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Crabp1P62965 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Crabp1P62965 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Crabp1P62965 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Crabp1P62965 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Crabp1P62965 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Crabp1P62965 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Crabp1P62965 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Crabp1P62965 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Crabp1P62965 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Crabp1P62965 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Crabp1P62965 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Crabp1P62965 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Crabp1P62965 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Crabp1P62965 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Crabp1P62965 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Crabp1P62965 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Crabp1P62965 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Crabp1P62965 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Crabp1P62965 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Crabp1P62965 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Crabp1P62965 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Crabp1P62965 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.1 ms