Protein–RNA interactions for Protein: P62858

Rps28, 40S ribosomal protein S28, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 69 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps28P62858 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Rps28P62858 Uimc1-202ENSMUST00000099496 1678 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Rps28P62858 Ermard-202ENSMUST00000061688 2120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Rps28P62858 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Rps28P62858 Aim2-202ENSMUST00000147604 2839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Rps28P62858 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Rps28P62858 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Rps28P62858 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Rps28P62858 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Rps28P62858 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Rps28P62858 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Rps28P62858 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Rps28P62858 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Rps28P62858 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
Rps28P62858 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Rps28P62858 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Rps28P62858 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Rps28P62858 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Rps28P62858 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC10□□□□□ -0.81
Rps28P62858 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Rps28P62858 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Rps28P62858 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Rps28P62858 Gm14168-201ENSMUST00000144818 2197 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Rps28P62858 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Rps28P62858 Gm45053-201ENSMUST00000206112 2499 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Rps28P62858 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Rps28P62858 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Rps28P62858 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Rps28P62858 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Rps28P62858 Mob1a-202ENSMUST00000055261 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Rps28P62858 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Rps28P62858 Erg-206ENSMUST00000122199 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Rps28P62858 Nfatc2ip-201ENSMUST00000075671 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Rps28P62858 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Rps28P62858 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Rps28P62858 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Rps28P62858 Cadps2-209ENSMUST00000142913 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Rps28P62858 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Rps28P62858 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Rps28P62858 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Rps28P62858 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Rps28P62858 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Rps28P62858 Syt1-201ENSMUST00000064054 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Rps28P62858 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Rps28P62858 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Rps28P62858 Tmed8-201ENSMUST00000037418 7409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Rps28P62858 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Rps28P62858 Zfp740-201ENSMUST00000118729 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Rps28P62858 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Rps28P62858 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Rps28P62858 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Rps28P62858 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Rps28P62858 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Rps28P62858 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Rps28P62858 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Rps28P62858 Fut9-202ENSMUST00000108199 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Rps28P62858 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Rps28P62858 Armcx1-201ENSMUST00000035748 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Rps28P62858 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Rps28P62858 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Rps28P62858 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Rps28P62858 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Rps28P62858 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Rps28P62858 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Rps28P62858 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Rps28P62858 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Rps28P62858 Lrrc74b-201ENSMUST00000023442 2135 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Rps28P62858 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Rps28P62858 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Rps28P62858 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Rps28P62858 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Rps28P62858 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Rps28P62858 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Rps28P62858 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Rps28P62858 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Rps28P62858 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Rps28P62858 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Rps28P62858 Zfp109-201ENSMUST00000037448 1935 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Rps28P62858 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Rps28P62858 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Rps28P62858 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Rps28P62858 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Rps28P62858 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Rps28P62858 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Rps28P62858 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Rps28P62858 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Rps28P62858 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Rps28P62858 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Rps28P62858 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Rps28P62858 Fam192a-201ENSMUST00000034226 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Rps28P62858 Armcx6-202ENSMUST00000113194 2120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Rps28P62858 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Rps28P62858 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Rps28P62858 Hspa4-201ENSMUST00000020630 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Rps28P62858 P2ry2-201ENSMUST00000037540 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Rps28P62858 Prkca-202ENSMUST00000100302 2265 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Rps28P62858 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Rps28P62858 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Rps28P62858 Gm996-201ENSMUST00000114217 4881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Rps28P62858 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.8 ms