Protein–RNA interactions for Protein: P62307

Snrpf, Small nuclear ribonucleoprotein F, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 86 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SnrpfP62307 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SnrpfP62307 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SnrpfP62307 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SnrpfP62307 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SnrpfP62307 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SnrpfP62307 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SnrpfP62307 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SnrpfP62307 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SnrpfP62307 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SnrpfP62307 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SnrpfP62307 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SnrpfP62307 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SnrpfP62307 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SnrpfP62307 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SnrpfP62307 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SnrpfP62307 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SnrpfP62307 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SnrpfP62307 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SnrpfP62307 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SnrpfP62307 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SnrpfP62307 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SnrpfP62307 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SnrpfP62307 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SnrpfP62307 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SnrpfP62307 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SnrpfP62307 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SnrpfP62307 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SnrpfP62307 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SnrpfP62307 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SnrpfP62307 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SnrpfP62307 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SnrpfP62307 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SnrpfP62307 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SnrpfP62307 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SnrpfP62307 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SnrpfP62307 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SnrpfP62307 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SnrpfP62307 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SnrpfP62307 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SnrpfP62307 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SnrpfP62307 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SnrpfP62307 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
SnrpfP62307 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
SnrpfP62307 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SnrpfP62307 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SnrpfP62307 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SnrpfP62307 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SnrpfP62307 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SnrpfP62307 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
SnrpfP62307 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SnrpfP62307 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SnrpfP62307 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SnrpfP62307 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SnrpfP62307 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SnrpfP62307 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SnrpfP62307 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
SnrpfP62307 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SnrpfP62307 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SnrpfP62307 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SnrpfP62307 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SnrpfP62307 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SnrpfP62307 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SnrpfP62307 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SnrpfP62307 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SnrpfP62307 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
SnrpfP62307 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SnrpfP62307 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SnrpfP62307 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SnrpfP62307 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SnrpfP62307 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
SnrpfP62307 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SnrpfP62307 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SnrpfP62307 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SnrpfP62307 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SnrpfP62307 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SnrpfP62307 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SnrpfP62307 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SnrpfP62307 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SnrpfP62307 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SnrpfP62307 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SnrpfP62307 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SnrpfP62307 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SnrpfP62307 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SnrpfP62307 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SnrpfP62307 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SnrpfP62307 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SnrpfP62307 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SnrpfP62307 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SnrpfP62307 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SnrpfP62307 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SnrpfP62307 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SnrpfP62307 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SnrpfP62307 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SnrpfP62307 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SnrpfP62307 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
SnrpfP62307 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SnrpfP62307 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SnrpfP62307 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SnrpfP62307 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SnrpfP62307 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.3 ms