Protein–RNA interactions for Protein: P61358

Rpl27, 60S ribosomal protein L27, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 136 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl27P61358 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Rpl27P61358 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Rpl27P61358 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Rpl27P61358 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Rpl27P61358 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Rpl27P61358 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Rpl27P61358 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Rpl27P61358 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Rpl27P61358 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Rpl27P61358 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Rpl27P61358 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Rpl27P61358 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Rpl27P61358 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Rpl27P61358 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Rpl27P61358 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Rpl27P61358 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Rpl27P61358 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Rpl27P61358 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Rpl27P61358 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Rpl27P61358 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Rpl27P61358 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Rpl27P61358 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Rpl27P61358 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Rpl27P61358 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
Rpl27P61358 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Rpl27P61358 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Rpl27P61358 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Rpl27P61358 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rpl27P61358 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rpl27P61358 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rpl27P61358 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rpl27P61358 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rpl27P61358 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rpl27P61358 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rpl27P61358 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rpl27P61358 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Rpl27P61358 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rpl27P61358 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rpl27P61358 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rpl27P61358 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rpl27P61358 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rpl27P61358 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rpl27P61358 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rpl27P61358 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rpl27P61358 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rpl27P61358 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rpl27P61358 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rpl27P61358 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rpl27P61358 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rpl27P61358 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rpl27P61358 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rpl27P61358 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rpl27P61358 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Rpl27P61358 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rpl27P61358 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rpl27P61358 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rpl27P61358 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rpl27P61358 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rpl27P61358 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rpl27P61358 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rpl27P61358 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rpl27P61358 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rpl27P61358 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rpl27P61358 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rpl27P61358 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rpl27P61358 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rpl27P61358 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rpl27P61358 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rpl27P61358 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rpl27P61358 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rpl27P61358 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rpl27P61358 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rpl27P61358 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rpl27P61358 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rpl27P61358 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rpl27P61358 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rpl27P61358 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rpl27P61358 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rpl27P61358 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rpl27P61358 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rpl27P61358 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rpl27P61358 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rpl27P61358 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Rpl27P61358 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Rpl27P61358 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Rpl27P61358 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rpl27P61358 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rpl27P61358 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rpl27P61358 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rpl27P61358 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rpl27P61358 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rpl27P61358 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rpl27P61358 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rpl27P61358 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rpl27P61358 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rpl27P61358 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rpl27P61358 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rpl27P61358 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rpl27P61358 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rpl27P61358 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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