Protein–RNA interactions for Protein: P61148

Fgf1, Fibroblast growth factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 155 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fgf1P61148 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Fgf1P61148 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Fgf1P61148 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Fgf1P61148 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Fgf1P61148 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Fgf1P61148 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Fgf1P61148 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Fgf1P61148 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Fgf1P61148 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Fgf1P61148 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Fgf1P61148 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Fgf1P61148 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Fgf1P61148 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Fgf1P61148 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Fgf1P61148 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Fgf1P61148 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Fgf1P61148 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Fgf1P61148 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Fgf1P61148 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Fgf1P61148 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Fgf1P61148 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Fgf1P61148 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Fgf1P61148 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Fgf1P61148 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Fgf1P61148 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Fgf1P61148 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Fgf1P61148 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Fgf1P61148 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Fgf1P61148 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Fgf1P61148 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Fgf1P61148 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Fgf1P61148 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Fgf1P61148 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Fgf1P61148 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Fgf1P61148 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Fgf1P61148 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Fgf1P61148 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Fgf1P61148 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Fgf1P61148 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Fgf1P61148 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Fgf1P61148 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Fgf1P61148 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Fgf1P61148 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Fgf1P61148 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Fgf1P61148 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Fgf1P61148 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Fgf1P61148 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Fgf1P61148 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Fgf1P61148 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Fgf1P61148 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Fgf1P61148 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Fgf1P61148 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Fgf1P61148 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Fgf1P61148 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Fgf1P61148 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Fgf1P61148 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Fgf1P61148 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Fgf1P61148 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Fgf1P61148 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Fgf1P61148 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Fgf1P61148 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Fgf1P61148 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Fgf1P61148 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Fgf1P61148 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Fgf1P61148 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Fgf1P61148 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Fgf1P61148 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Fgf1P61148 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Fgf1P61148 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Fgf1P61148 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Fgf1P61148 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Fgf1P61148 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Fgf1P61148 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Fgf1P61148 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Fgf1P61148 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Fgf1P61148 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Fgf1P61148 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Fgf1P61148 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Fgf1P61148 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Fgf1P61148 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Fgf1P61148 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Fgf1P61148 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Fgf1P61148 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Fgf1P61148 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Fgf1P61148 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Fgf1P61148 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Fgf1P61148 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Fgf1P61148 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Fgf1P61148 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Fgf1P61148 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Fgf1P61148 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Fgf1P61148 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Fgf1P61148 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Fgf1P61148 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Fgf1P61148 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Fgf1P61148 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Fgf1P61148 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Fgf1P61148 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Fgf1P61148 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Fgf1P61148 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.2 ms