Protein–RNA interactions for Protein: P60897

Sem1, 26S proteasome complex subunit SEM1, mousemouse

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Length 70 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sem1P60897 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sem1P60897 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sem1P60897 Chtop-206ENSMUST00000107344 2972 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sem1P60897 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Sem1P60897 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sem1P60897 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sem1P60897 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sem1P60897 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sem1P60897 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Sem1P60897 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sem1P60897 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sem1P60897 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sem1P60897 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sem1P60897 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sem1P60897 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sem1P60897 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sem1P60897 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sem1P60897 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sem1P60897 Tpr-203ENSMUST00000124973 7430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sem1P60897 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sem1P60897 D430041D05Rik-201ENSMUST00000089726 10124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sem1P60897 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sem1P60897 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sem1P60897 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sem1P60897 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sem1P60897 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sem1P60897 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sem1P60897 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sem1P60897 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sem1P60897 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sem1P60897 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sem1P60897 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sem1P60897 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sem1P60897 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sem1P60897 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sem1P60897 Ints3-202ENSMUST00000071488 4038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sem1P60897 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sem1P60897 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sem1P60897 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sem1P60897 Pcdha11-201ENSMUST00000115658 5359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sem1P60897 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sem1P60897 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sem1P60897 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sem1P60897 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sem1P60897 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sem1P60897 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sem1P60897 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sem1P60897 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sem1P60897 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sem1P60897 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sem1P60897 Cybrd1-201ENSMUST00000028403 5339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sem1P60897 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sem1P60897 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sem1P60897 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sem1P60897 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sem1P60897 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sem1P60897 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sem1P60897 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sem1P60897 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sem1P60897 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sem1P60897 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sem1P60897 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sem1P60897 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sem1P60897 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sem1P60897 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sem1P60897 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sem1P60897 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sem1P60897 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sem1P60897 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sem1P60897 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sem1P60897 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sem1P60897 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sem1P60897 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sem1P60897 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sem1P60897 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sem1P60897 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sem1P60897 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sem1P60897 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sem1P60897 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sem1P60897 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sem1P60897 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sem1P60897 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sem1P60897 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sem1P60897 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Sem1P60897 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sem1P60897 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sem1P60897 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Sem1P60897 Arid1b-202ENSMUST00000115797 11325 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sem1P60897 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sem1P60897 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sem1P60897 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sem1P60897 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sem1P60897 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sem1P60897 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sem1P60897 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sem1P60897 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sem1P60897 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sem1P60897 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sem1P60897 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sem1P60897 Scn4b-201ENSMUST00000060125 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
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