Protein–RNA interactions for Protein: P59729

Rin3, Ras and Rab interactor 3, mousemouse

Predictions only

Length 980 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rin3P59729 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Rin3P59729 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rin3P59729 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rin3P59729 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Rin3P59729 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rin3P59729 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rin3P59729 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rin3P59729 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rin3P59729 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rin3P59729 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rin3P59729 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rin3P59729 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rin3P59729 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rin3P59729 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rin3P59729 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rin3P59729 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rin3P59729 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Rin3P59729 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rin3P59729 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rin3P59729 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rin3P59729 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rin3P59729 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rin3P59729 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rin3P59729 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rin3P59729 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rin3P59729 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Rin3P59729 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rin3P59729 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rin3P59729 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rin3P59729 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rin3P59729 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rin3P59729 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rin3P59729 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rin3P59729 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rin3P59729 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Rin3P59729 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rin3P59729 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rin3P59729 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rin3P59729 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rin3P59729 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rin3P59729 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rin3P59729 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rin3P59729 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rin3P59729 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rin3P59729 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rin3P59729 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rin3P59729 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rin3P59729 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rin3P59729 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rin3P59729 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rin3P59729 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rin3P59729 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rin3P59729 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rin3P59729 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rin3P59729 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rin3P59729 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC17.21■□□□□ 0.34
Rin3P59729 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rin3P59729 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rin3P59729 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rin3P59729 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rin3P59729 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rin3P59729 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rin3P59729 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rin3P59729 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rin3P59729 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Rin3P59729 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rin3P59729 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Rin3P59729 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Rin3P59729 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Rin3P59729 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rin3P59729 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rin3P59729 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rin3P59729 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rin3P59729 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rin3P59729 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rin3P59729 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rin3P59729 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rin3P59729 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rin3P59729 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rin3P59729 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rin3P59729 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rin3P59729 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rin3P59729 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rin3P59729 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rin3P59729 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rin3P59729 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rin3P59729 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rin3P59729 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rin3P59729 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rin3P59729 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Rin3P59729 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Rin3P59729 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rin3P59729 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rin3P59729 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Rin3P59729 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rin3P59729 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rin3P59729 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rin3P59729 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rin3P59729 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rin3P59729 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.4 ms