Protein–RNA interactions for Protein: P58501

Paxbp1, PAX3- and PAX7-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 919 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Paxbp1P58501 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Paxbp1P58501 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Paxbp1P58501 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Paxbp1P58501 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Paxbp1P58501 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Paxbp1P58501 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Paxbp1P58501 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Paxbp1P58501 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Paxbp1P58501 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Paxbp1P58501 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Paxbp1P58501 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Paxbp1P58501 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Paxbp1P58501 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Paxbp1P58501 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Paxbp1P58501 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Paxbp1P58501 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Paxbp1P58501 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Paxbp1P58501 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Paxbp1P58501 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Paxbp1P58501 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Paxbp1P58501 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Paxbp1P58501 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Paxbp1P58501 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Paxbp1P58501 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Paxbp1P58501 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Paxbp1P58501 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Paxbp1P58501 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Paxbp1P58501 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Paxbp1P58501 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Paxbp1P58501 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Paxbp1P58501 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Paxbp1P58501 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Paxbp1P58501 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Paxbp1P58501 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Paxbp1P58501 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Paxbp1P58501 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Paxbp1P58501 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Paxbp1P58501 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Paxbp1P58501 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Paxbp1P58501 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Paxbp1P58501 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Paxbp1P58501 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Paxbp1P58501 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Paxbp1P58501 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Paxbp1P58501 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Paxbp1P58501 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Paxbp1P58501 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Paxbp1P58501 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Paxbp1P58501 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Paxbp1P58501 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Paxbp1P58501 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Paxbp1P58501 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Paxbp1P58501 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Paxbp1P58501 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Paxbp1P58501 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Paxbp1P58501 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Paxbp1P58501 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Paxbp1P58501 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Paxbp1P58501 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Paxbp1P58501 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Paxbp1P58501 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Paxbp1P58501 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Paxbp1P58501 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Paxbp1P58501 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Paxbp1P58501 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Paxbp1P58501 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Paxbp1P58501 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Paxbp1P58501 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Paxbp1P58501 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Paxbp1P58501 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Paxbp1P58501 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Paxbp1P58501 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Paxbp1P58501 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Paxbp1P58501 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Paxbp1P58501 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Paxbp1P58501 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Paxbp1P58501 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Paxbp1P58501 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Paxbp1P58501 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Paxbp1P58501 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Paxbp1P58501 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Paxbp1P58501 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Paxbp1P58501 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Paxbp1P58501 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Paxbp1P58501 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Paxbp1P58501 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Paxbp1P58501 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Paxbp1P58501 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Paxbp1P58501 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Paxbp1P58501 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Paxbp1P58501 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Paxbp1P58501 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Paxbp1P58501 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Paxbp1P58501 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Paxbp1P58501 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Paxbp1P58501 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Paxbp1P58501 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Paxbp1P58501 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Paxbp1P58501 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Paxbp1P58501 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms