Protein–RNA interactions for Protein: P58467

Setd4, SET domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Setd4P58467 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Setd4P58467 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Setd4P58467 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Setd4P58467 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Setd4P58467 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Setd4P58467 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Setd4P58467 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Setd4P58467 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Setd4P58467 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Setd4P58467 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Setd4P58467 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Setd4P58467 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Setd4P58467 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Setd4P58467 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Setd4P58467 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Setd4P58467 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Setd4P58467 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Setd4P58467 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Setd4P58467 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Setd4P58467 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Setd4P58467 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Setd4P58467 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Setd4P58467 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Setd4P58467 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Setd4P58467 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Setd4P58467 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Setd4P58467 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Setd4P58467 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Setd4P58467 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Setd4P58467 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Setd4P58467 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Setd4P58467 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Setd4P58467 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Setd4P58467 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Setd4P58467 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Setd4P58467 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Setd4P58467 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Setd4P58467 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Setd4P58467 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Setd4P58467 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Setd4P58467 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Setd4P58467 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Setd4P58467 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Setd4P58467 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Setd4P58467 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Setd4P58467 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Setd4P58467 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Setd4P58467 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Setd4P58467 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Setd4P58467 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Setd4P58467 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Setd4P58467 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Setd4P58467 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Setd4P58467 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Setd4P58467 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Setd4P58467 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Setd4P58467 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Setd4P58467 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Setd4P58467 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Setd4P58467 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Setd4P58467 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Setd4P58467 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Setd4P58467 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Setd4P58467 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Setd4P58467 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Setd4P58467 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Setd4P58467 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Setd4P58467 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Setd4P58467 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Setd4P58467 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Setd4P58467 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Setd4P58467 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Setd4P58467 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Setd4P58467 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Setd4P58467 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Setd4P58467 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Setd4P58467 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Setd4P58467 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Setd4P58467 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Setd4P58467 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Setd4P58467 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Setd4P58467 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Setd4P58467 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Setd4P58467 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Setd4P58467 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Setd4P58467 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Setd4P58467 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Setd4P58467 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Setd4P58467 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Setd4P58467 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Setd4P58467 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Setd4P58467 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Setd4P58467 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Setd4P58467 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Setd4P58467 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Setd4P58467 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Setd4P58467 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Setd4P58467 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Setd4P58467 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Setd4P58467 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.5 ms