Protein–RNA interactions for Protein: P57722

Pcbp3, Poly(rC)-binding protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 371 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcbp3P57722 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pcbp3P57722 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pcbp3P57722 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pcbp3P57722 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pcbp3P57722 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pcbp3P57722 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pcbp3P57722 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pcbp3P57722 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pcbp3P57722 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pcbp3P57722 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pcbp3P57722 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pcbp3P57722 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Pcbp3P57722 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pcbp3P57722 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pcbp3P57722 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pcbp3P57722 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pcbp3P57722 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pcbp3P57722 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Pcbp3P57722 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pcbp3P57722 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pcbp3P57722 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pcbp3P57722 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pcbp3P57722 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pcbp3P57722 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pcbp3P57722 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pcbp3P57722 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pcbp3P57722 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pcbp3P57722 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pcbp3P57722 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pcbp3P57722 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pcbp3P57722 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pcbp3P57722 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pcbp3P57722 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pcbp3P57722 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pcbp3P57722 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pcbp3P57722 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pcbp3P57722 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pcbp3P57722 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pcbp3P57722 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pcbp3P57722 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pcbp3P57722 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pcbp3P57722 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pcbp3P57722 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pcbp3P57722 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pcbp3P57722 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pcbp3P57722 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Pcbp3P57722 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pcbp3P57722 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pcbp3P57722 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pcbp3P57722 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Pcbp3P57722 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pcbp3P57722 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pcbp3P57722 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pcbp3P57722 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pcbp3P57722 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pcbp3P57722 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pcbp3P57722 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pcbp3P57722 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pcbp3P57722 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pcbp3P57722 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pcbp3P57722 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pcbp3P57722 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pcbp3P57722 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pcbp3P57722 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pcbp3P57722 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pcbp3P57722 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pcbp3P57722 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pcbp3P57722 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pcbp3P57722 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pcbp3P57722 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pcbp3P57722 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pcbp3P57722 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pcbp3P57722 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pcbp3P57722 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pcbp3P57722 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pcbp3P57722 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pcbp3P57722 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pcbp3P57722 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pcbp3P57722 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Pcbp3P57722 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pcbp3P57722 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pcbp3P57722 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pcbp3P57722 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pcbp3P57722 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pcbp3P57722 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pcbp3P57722 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pcbp3P57722 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pcbp3P57722 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Pcbp3P57722 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Pcbp3P57722 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Pcbp3P57722 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Pcbp3P57722 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Pcbp3P57722 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pcbp3P57722 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pcbp3P57722 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pcbp3P57722 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pcbp3P57722 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pcbp3P57722 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pcbp3P57722 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pcbp3P57722 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.9 ms