Protein–RNA interactions for Protein: P57080

Usp25, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 25, mousemouse

Predictions only

Length 1,055 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp25P57080 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
Usp25P57080 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Usp25P57080 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Usp25P57080 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Usp25P57080 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Usp25P57080 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Usp25P57080 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Usp25P57080 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Usp25P57080 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Usp25P57080 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Usp25P57080 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Usp25P57080 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Usp25P57080 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Usp25P57080 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Usp25P57080 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Usp25P57080 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Usp25P57080 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Usp25P57080 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Usp25P57080 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Usp25P57080 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Usp25P57080 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Usp25P57080 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Usp25P57080 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Usp25P57080 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Usp25P57080 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
Usp25P57080 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Usp25P57080 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Usp25P57080 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Usp25P57080 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Usp25P57080 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Usp25P57080 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
Usp25P57080 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Usp25P57080 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
Usp25P57080 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Usp25P57080 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Usp25P57080 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Usp25P57080 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Usp25P57080 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Usp25P57080 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Usp25P57080 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Usp25P57080 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Usp25P57080 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Usp25P57080 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Usp25P57080 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Usp25P57080 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Usp25P57080 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Usp25P57080 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Usp25P57080 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Usp25P57080 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Usp25P57080 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Usp25P57080 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Usp25P57080 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Usp25P57080 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Usp25P57080 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Usp25P57080 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Usp25P57080 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Usp25P57080 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
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Usp25P57080 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Usp25P57080 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Usp25P57080 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
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Usp25P57080 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
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Usp25P57080 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
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Usp25P57080 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Usp25P57080 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Usp25P57080 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Usp25P57080 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Usp25P57080 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Usp25P57080 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Usp25P57080 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Usp25P57080 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Usp25P57080 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Usp25P57080 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Usp25P57080 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Usp25P57080 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Usp25P57080 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Usp25P57080 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Usp25P57080 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Usp25P57080 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Usp25P57080 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Usp25P57080 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
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Usp25P57080 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Usp25P57080 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Usp25P57080 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Usp25P57080 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Usp25P57080 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Usp25P57080 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Usp25P57080 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Usp25P57080 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Usp25P57080 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.2 ms