Protein–RNA interactions for Protein: P56382

Atp5e, ATP synthase subunit epsilon, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 52 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp5eP56382 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Atp5eP56382 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Atp5eP56382 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Atp5eP56382 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Atp5eP56382 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Atp5eP56382 Kcnma1-214ENSMUST00000190044 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Atp5eP56382 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Atp5eP56382 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Atp5eP56382 Nid2-201ENSMUST00000022340 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Atp5eP56382 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Atp5eP56382 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Atp5eP56382 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Atp5eP56382 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Atp5eP56382 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Atp5eP56382 Kcnk16-202ENSMUST00000225596 2127 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Atp5eP56382 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Atp5eP56382 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Atp5eP56382 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Atp5eP56382 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Atp5eP56382 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Atp5eP56382 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Atp5eP56382 Mkrn1-201ENSMUST00000031985 3046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Atp5eP56382 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Atp5eP56382 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Atp5eP56382 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Atp5eP56382 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Atp5eP56382 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Atp5eP56382 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Atp5eP56382 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Atp5eP56382 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Atp5eP56382 Armcx1-202ENSMUST00000051256 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Atp5eP56382 AC153366.2-201ENSMUST00000219461 1984 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Atp5eP56382 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Atp5eP56382 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Atp5eP56382 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Atp5eP56382 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Atp5eP56382 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Atp5eP56382 Kif21b-201ENSMUST00000075164 9115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Atp5eP56382 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Atp5eP56382 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Atp5eP56382 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Atp5eP56382 Gtf2ird1-201ENSMUST00000073161 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Atp5eP56382 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Atp5eP56382 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Atp5eP56382 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Atp5eP56382 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Atp5eP56382 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Atp5eP56382 A730062M13Rik-201ENSMUST00000192843 1910 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Atp5eP56382 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Atp5eP56382 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Atp5eP56382 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Atp5eP56382 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Atp5eP56382 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Atp5eP56382 Syt1-201ENSMUST00000064054 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Atp5eP56382 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Atp5eP56382 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Atp5eP56382 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Atp5eP56382 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Atp5eP56382 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Atp5eP56382 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Atp5eP56382 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Atp5eP56382 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Atp5eP56382 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Atp5eP56382 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Atp5eP56382 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Atp5eP56382 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Atp5eP56382 AI593442-203ENSMUST00000213937 5674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Atp5eP56382 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Atp5eP56382 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Atp5eP56382 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Atp5eP56382 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Atp5eP56382 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Atp5eP56382 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Atp5eP56382 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Atp5eP56382 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Atp5eP56382 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Atp5eP56382 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Atp5eP56382 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Atp5eP56382 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Atp5eP56382 Diaph2-207ENSMUST00000167619 8439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Atp5eP56382 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Atp5eP56382 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Atp5eP56382 Islr-202ENSMUST00000168864 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Atp5eP56382 Aspm-205ENSMUST00000200083 6072 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Atp5eP56382 St8sia3-201ENSMUST00000025477 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Atp5eP56382 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Atp5eP56382 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Atp5eP56382 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Atp5eP56382 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Atp5eP56382 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Atp5eP56382 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Atp5eP56382 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Atp5eP56382 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.68
Atp5eP56382 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.68
Atp5eP56382 Nfasc-201ENSMUST00000043189 5072 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Atp5eP56382 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Atp5eP56382 Gpr85-201ENSMUST00000060442 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Atp5eP56382 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Atp5eP56382 Ikzf1-204ENSMUST00000076700 5163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Atp5eP56382 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.1 ms