Protein–RNA interactions for Protein: P55098

Pex2, Peroxisome biogenesis factor 2, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pex2P55098 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pex2P55098 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pex2P55098 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pex2P55098 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pex2P55098 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pex2P55098 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pex2P55098 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pex2P55098 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pex2P55098 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pex2P55098 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pex2P55098 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pex2P55098 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pex2P55098 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pex2P55098 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pex2P55098 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pex2P55098 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pex2P55098 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pex2P55098 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pex2P55098 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pex2P55098 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pex2P55098 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pex2P55098 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pex2P55098 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pex2P55098 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pex2P55098 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pex2P55098 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pex2P55098 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pex2P55098 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Pex2P55098 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pex2P55098 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pex2P55098 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pex2P55098 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pex2P55098 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pex2P55098 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pex2P55098 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Pex2P55098 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pex2P55098 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pex2P55098 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pex2P55098 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pex2P55098 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pex2P55098 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pex2P55098 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pex2P55098 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pex2P55098 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Pex2P55098 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pex2P55098 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pex2P55098 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pex2P55098 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pex2P55098 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pex2P55098 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pex2P55098 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pex2P55098 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pex2P55098 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pex2P55098 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pex2P55098 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pex2P55098 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pex2P55098 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pex2P55098 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pex2P55098 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pex2P55098 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pex2P55098 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pex2P55098 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pex2P55098 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pex2P55098 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pex2P55098 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pex2P55098 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pex2P55098 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pex2P55098 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pex2P55098 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pex2P55098 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pex2P55098 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pex2P55098 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pex2P55098 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pex2P55098 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pex2P55098 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pex2P55098 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pex2P55098 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pex2P55098 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pex2P55098 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pex2P55098 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pex2P55098 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pex2P55098 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pex2P55098 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Pex2P55098 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pex2P55098 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pex2P55098 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Pex2P55098 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pex2P55098 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pex2P55098 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pex2P55098 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pex2P55098 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pex2P55098 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pex2P55098 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pex2P55098 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pex2P55098 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pex2P55098 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pex2P55098 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pex2P55098 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pex2P55098 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pex2P55098 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.6 ms