Protein–RNA interactions for Protein: P55065

Pltp, Phospholipid transfer protein, mousemouse

Predictions only

Length 493 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PltpP55065 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PltpP55065 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PltpP55065 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PltpP55065 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PltpP55065 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PltpP55065 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PltpP55065 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PltpP55065 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PltpP55065 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PltpP55065 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PltpP55065 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PltpP55065 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PltpP55065 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PltpP55065 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PltpP55065 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PltpP55065 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PltpP55065 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PltpP55065 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PltpP55065 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PltpP55065 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PltpP55065 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PltpP55065 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PltpP55065 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
PltpP55065 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PltpP55065 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PltpP55065 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PltpP55065 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PltpP55065 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PltpP55065 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PltpP55065 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PltpP55065 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PltpP55065 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PltpP55065 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PltpP55065 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PltpP55065 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PltpP55065 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PltpP55065 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PltpP55065 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PltpP55065 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PltpP55065 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PltpP55065 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PltpP55065 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PltpP55065 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PltpP55065 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PltpP55065 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PltpP55065 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PltpP55065 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PltpP55065 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PltpP55065 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PltpP55065 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PltpP55065 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PltpP55065 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PltpP55065 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PltpP55065 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PltpP55065 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PltpP55065 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PltpP55065 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PltpP55065 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PltpP55065 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
PltpP55065 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PltpP55065 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
PltpP55065 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
PltpP55065 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PltpP55065 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
PltpP55065 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PltpP55065 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PltpP55065 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PltpP55065 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PltpP55065 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PltpP55065 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PltpP55065 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PltpP55065 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PltpP55065 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PltpP55065 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PltpP55065 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PltpP55065 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PltpP55065 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PltpP55065 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PltpP55065 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PltpP55065 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PltpP55065 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PltpP55065 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PltpP55065 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PltpP55065 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PltpP55065 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PltpP55065 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PltpP55065 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PltpP55065 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PltpP55065 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PltpP55065 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PltpP55065 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PltpP55065 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PltpP55065 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PltpP55065 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PltpP55065 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PltpP55065 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PltpP55065 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PltpP55065 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PltpP55065 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PltpP55065 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.5 ms