Protein–RNA interactions for Protein: P54731

Faf1, FAS-associated factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 649 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Faf1P54731 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Faf1P54731 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Faf1P54731 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Faf1P54731 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Faf1P54731 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Faf1P54731 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Faf1P54731 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Faf1P54731 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Faf1P54731 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Faf1P54731 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Faf1P54731 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Faf1P54731 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Faf1P54731 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Faf1P54731 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Faf1P54731 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Faf1P54731 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Faf1P54731 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Faf1P54731 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Faf1P54731 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Faf1P54731 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Faf1P54731 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Faf1P54731 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Faf1P54731 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Faf1P54731 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Faf1P54731 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Faf1P54731 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Faf1P54731 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Faf1P54731 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Faf1P54731 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Faf1P54731 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Faf1P54731 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Faf1P54731 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Faf1P54731 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Faf1P54731 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Faf1P54731 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Faf1P54731 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Faf1P54731 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Faf1P54731 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Faf1P54731 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Faf1P54731 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Faf1P54731 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Faf1P54731 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Faf1P54731 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Faf1P54731 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Faf1P54731 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Faf1P54731 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Faf1P54731 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Faf1P54731 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Faf1P54731 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Faf1P54731 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Faf1P54731 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Faf1P54731 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Faf1P54731 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Faf1P54731 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Faf1P54731 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Faf1P54731 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Faf1P54731 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Faf1P54731 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Faf1P54731 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Faf1P54731 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Faf1P54731 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Faf1P54731 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Faf1P54731 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Faf1P54731 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Faf1P54731 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Faf1P54731 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Faf1P54731 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Faf1P54731 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Faf1P54731 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Faf1P54731 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Faf1P54731 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Faf1P54731 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Faf1P54731 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Faf1P54731 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Faf1P54731 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Faf1P54731 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Faf1P54731 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Faf1P54731 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Faf1P54731 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Faf1P54731 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Faf1P54731 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Faf1P54731 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Faf1P54731 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Faf1P54731 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Faf1P54731 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Faf1P54731 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Faf1P54731 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Faf1P54731 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Faf1P54731 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Faf1P54731 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Faf1P54731 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Faf1P54731 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Faf1P54731 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Faf1P54731 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Faf1P54731 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Faf1P54731 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Faf1P54731 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Faf1P54731 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Faf1P54731 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Faf1P54731 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.8 ms