Protein–RNA interactions for Protein: P53808

Pctp, Phosphatidylcholine transfer protein, mousemouse

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PctpP53808 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
PctpP53808 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
PctpP53808 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
PctpP53808 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
PctpP53808 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PctpP53808 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PctpP53808 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PctpP53808 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PctpP53808 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PctpP53808 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PctpP53808 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PctpP53808 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PctpP53808 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PctpP53808 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PctpP53808 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PctpP53808 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PctpP53808 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PctpP53808 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PctpP53808 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PctpP53808 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PctpP53808 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PctpP53808 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
PctpP53808 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PctpP53808 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PctpP53808 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PctpP53808 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PctpP53808 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PctpP53808 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PctpP53808 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PctpP53808 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PctpP53808 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PctpP53808 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PctpP53808 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PctpP53808 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PctpP53808 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PctpP53808 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PctpP53808 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PctpP53808 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PctpP53808 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PctpP53808 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PctpP53808 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PctpP53808 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PctpP53808 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PctpP53808 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PctpP53808 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PctpP53808 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PctpP53808 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PctpP53808 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
PctpP53808 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PctpP53808 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PctpP53808 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PctpP53808 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PctpP53808 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PctpP53808 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PctpP53808 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PctpP53808 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PctpP53808 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PctpP53808 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PctpP53808 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
PctpP53808 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PctpP53808 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PctpP53808 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PctpP53808 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PctpP53808 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PctpP53808 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PctpP53808 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PctpP53808 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
PctpP53808 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PctpP53808 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PctpP53808 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
PctpP53808 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PctpP53808 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PctpP53808 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PctpP53808 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PctpP53808 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PctpP53808 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PctpP53808 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PctpP53808 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PctpP53808 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PctpP53808 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
PctpP53808 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PctpP53808 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PctpP53808 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PctpP53808 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PctpP53808 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PctpP53808 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PctpP53808 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PctpP53808 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PctpP53808 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PctpP53808 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PctpP53808 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PctpP53808 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PctpP53808 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PctpP53808 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
PctpP53808 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PctpP53808 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PctpP53808 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PctpP53808 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PctpP53808 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PctpP53808 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.7 ms