Protein–RNA interactions for Protein: P53612

Rabggtb, Geranylgeranyl transferase type-2 subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 339 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RabggtbP53612 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
RabggtbP53612 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
RabggtbP53612 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
RabggtbP53612 Dynlt1b-201ENSMUST00000179569 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
RabggtbP53612 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
RabggtbP53612 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
RabggtbP53612 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
RabggtbP53612 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
RabggtbP53612 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
RabggtbP53612 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
RabggtbP53612 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
RabggtbP53612 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
RabggtbP53612 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
RabggtbP53612 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
RabggtbP53612 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
RabggtbP53612 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
RabggtbP53612 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
RabggtbP53612 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
RabggtbP53612 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
RabggtbP53612 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RabggtbP53612 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RabggtbP53612 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
RabggtbP53612 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RabggtbP53612 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RabggtbP53612 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
RabggtbP53612 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RabggtbP53612 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
RabggtbP53612 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
RabggtbP53612 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RabggtbP53612 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
RabggtbP53612 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RabggtbP53612 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
RabggtbP53612 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RabggtbP53612 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RabggtbP53612 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RabggtbP53612 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RabggtbP53612 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RabggtbP53612 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
RabggtbP53612 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
RabggtbP53612 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
RabggtbP53612 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
RabggtbP53612 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
RabggtbP53612 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
RabggtbP53612 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
RabggtbP53612 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
RabggtbP53612 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
RabggtbP53612 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
RabggtbP53612 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
RabggtbP53612 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
RabggtbP53612 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
RabggtbP53612 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
RabggtbP53612 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
RabggtbP53612 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
RabggtbP53612 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
RabggtbP53612 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
RabggtbP53612 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
RabggtbP53612 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
RabggtbP53612 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
RabggtbP53612 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
RabggtbP53612 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
RabggtbP53612 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
RabggtbP53612 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
RabggtbP53612 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
RabggtbP53612 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
RabggtbP53612 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
RabggtbP53612 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
RabggtbP53612 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
RabggtbP53612 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
RabggtbP53612 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
RabggtbP53612 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
RabggtbP53612 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
RabggtbP53612 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
RabggtbP53612 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
RabggtbP53612 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
RabggtbP53612 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
RabggtbP53612 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
RabggtbP53612 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
RabggtbP53612 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
RabggtbP53612 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
RabggtbP53612 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
RabggtbP53612 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
RabggtbP53612 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
RabggtbP53612 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
RabggtbP53612 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
RabggtbP53612 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
RabggtbP53612 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
RabggtbP53612 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
RabggtbP53612 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
RabggtbP53612 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
RabggtbP53612 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
RabggtbP53612 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
RabggtbP53612 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
RabggtbP53612 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
RabggtbP53612 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
RabggtbP53612 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
RabggtbP53612 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
RabggtbP53612 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
RabggtbP53612 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
RabggtbP53612 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
RabggtbP53612 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
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