Protein–RNA interactions for Protein: P53349

Map3k1, Mitogen-activated protein kinase kinase kinase 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,493 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Map3k1P53349 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Map3k1P53349 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
Map3k1P53349 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
Map3k1P53349 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Map3k1P53349 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Map3k1P53349 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Map3k1P53349 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Map3k1P53349 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Map3k1P53349 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
Map3k1P53349 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Map3k1P53349 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Map3k1P53349 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Map3k1P53349 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
Map3k1P53349 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Map3k1P53349 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Map3k1P53349 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Map3k1P53349 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Map3k1P53349 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Map3k1P53349 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Map3k1P53349 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Map3k1P53349 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Map3k1P53349 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Map3k1P53349 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Map3k1P53349 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Map3k1P53349 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Map3k1P53349 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
Map3k1P53349 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Map3k1P53349 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Map3k1P53349 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Map3k1P53349 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Map3k1P53349 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Map3k1P53349 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Map3k1P53349 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
Map3k1P53349 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Map3k1P53349 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Map3k1P53349 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Map3k1P53349 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Map3k1P53349 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Map3k1P53349 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Map3k1P53349 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Map3k1P53349 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Map3k1P53349 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Map3k1P53349 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Map3k1P53349 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Map3k1P53349 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
Map3k1P53349 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Map3k1P53349 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
Map3k1P53349 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Map3k1P53349 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Map3k1P53349 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Map3k1P53349 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Map3k1P53349 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Map3k1P53349 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Map3k1P53349 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
Map3k1P53349 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
Map3k1P53349 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Map3k1P53349 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Map3k1P53349 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
Map3k1P53349 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Map3k1P53349 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Map3k1P53349 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Map3k1P53349 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Map3k1P53349 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Map3k1P53349 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Map3k1P53349 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Map3k1P53349 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Map3k1P53349 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.76
Map3k1P53349 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.76
Map3k1P53349 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Map3k1P53349 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Map3k1P53349 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Map3k1P53349 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Map3k1P53349 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Map3k1P53349 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Map3k1P53349 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Map3k1P53349 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Map3k1P53349 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Map3k1P53349 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Map3k1P53349 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Map3k1P53349 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Map3k1P53349 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Map3k1P53349 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
Map3k1P53349 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Map3k1P53349 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC26■■□□□ 1.75
Map3k1P53349 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
Map3k1P53349 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
Map3k1P53349 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Map3k1P53349 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Map3k1P53349 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Map3k1P53349 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Map3k1P53349 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Map3k1P53349 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Map3k1P53349 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Map3k1P53349 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Map3k1P53349 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Map3k1P53349 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Map3k1P53349 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Map3k1P53349 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Map3k1P53349 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Map3k1P53349 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.3 ms