Protein–RNA interactions for Protein: P52963

Epb41l4a, Band 4.1-like protein 4A, mousemouse

Predictions only

Length 686 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Epb41l4aP52963 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Epb41l4aP52963 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Epb41l4aP52963 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Epb41l4aP52963 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Epb41l4aP52963 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Epb41l4aP52963 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Epb41l4aP52963 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Epb41l4aP52963 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Epb41l4aP52963 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Epb41l4aP52963 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Epb41l4aP52963 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Epb41l4aP52963 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Epb41l4aP52963 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Epb41l4aP52963 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Epb41l4aP52963 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Epb41l4aP52963 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Epb41l4aP52963 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Epb41l4aP52963 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Epb41l4aP52963 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Epb41l4aP52963 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Epb41l4aP52963 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Epb41l4aP52963 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Epb41l4aP52963 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Epb41l4aP52963 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Epb41l4aP52963 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Epb41l4aP52963 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Epb41l4aP52963 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Epb41l4aP52963 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Epb41l4aP52963 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Epb41l4aP52963 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Epb41l4aP52963 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Epb41l4aP52963 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Epb41l4aP52963 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Epb41l4aP52963 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Epb41l4aP52963 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Epb41l4aP52963 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Epb41l4aP52963 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Epb41l4aP52963 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Epb41l4aP52963 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Epb41l4aP52963 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Epb41l4aP52963 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Epb41l4aP52963 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Epb41l4aP52963 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Epb41l4aP52963 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Epb41l4aP52963 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Epb41l4aP52963 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Epb41l4aP52963 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Epb41l4aP52963 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Epb41l4aP52963 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Epb41l4aP52963 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Epb41l4aP52963 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Epb41l4aP52963 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Epb41l4aP52963 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Epb41l4aP52963 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Epb41l4aP52963 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Epb41l4aP52963 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Epb41l4aP52963 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Epb41l4aP52963 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Epb41l4aP52963 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Epb41l4aP52963 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Epb41l4aP52963 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Epb41l4aP52963 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Epb41l4aP52963 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Epb41l4aP52963 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Epb41l4aP52963 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Epb41l4aP52963 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Epb41l4aP52963 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Epb41l4aP52963 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Epb41l4aP52963 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Epb41l4aP52963 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Epb41l4aP52963 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Epb41l4aP52963 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Epb41l4aP52963 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Epb41l4aP52963 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Epb41l4aP52963 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Epb41l4aP52963 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Epb41l4aP52963 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Epb41l4aP52963 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Epb41l4aP52963 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Epb41l4aP52963 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Epb41l4aP52963 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Epb41l4aP52963 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Epb41l4aP52963 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Epb41l4aP52963 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Epb41l4aP52963 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Epb41l4aP52963 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Epb41l4aP52963 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Epb41l4aP52963 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Epb41l4aP52963 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Epb41l4aP52963 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Epb41l4aP52963 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Epb41l4aP52963 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Epb41l4aP52963 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Epb41l4aP52963 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Epb41l4aP52963 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Epb41l4aP52963 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Epb41l4aP52963 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Epb41l4aP52963 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Epb41l4aP52963 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Epb41l4aP52963 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17 ms