Protein–RNA interactions for Protein: P52734

Fgd1, FYVE, RhoGEF and PH domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 960 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fgd1P52734 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Fgd1P52734 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Fgd1P52734 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Fgd1P52734 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Fgd1P52734 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Fgd1P52734 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Fgd1P52734 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Fgd1P52734 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Fgd1P52734 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Fgd1P52734 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Fgd1P52734 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Fgd1P52734 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Fgd1P52734 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Fgd1P52734 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Fgd1P52734 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Fgd1P52734 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Fgd1P52734 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Fgd1P52734 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Fgd1P52734 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Fgd1P52734 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Fgd1P52734 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Fgd1P52734 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Fgd1P52734 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Fgd1P52734 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Fgd1P52734 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Fgd1P52734 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Fgd1P52734 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Fgd1P52734 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Fgd1P52734 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Fgd1P52734 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Fgd1P52734 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Fgd1P52734 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Fgd1P52734 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Fgd1P52734 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Fgd1P52734 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Fgd1P52734 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Fgd1P52734 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Fgd1P52734 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Fgd1P52734 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Fgd1P52734 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Fgd1P52734 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Fgd1P52734 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Fgd1P52734 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Fgd1P52734 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Fgd1P52734 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Fgd1P52734 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Fgd1P52734 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Fgd1P52734 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Fgd1P52734 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Fgd1P52734 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Fgd1P52734 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Fgd1P52734 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Fgd1P52734 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Fgd1P52734 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Fgd1P52734 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Fgd1P52734 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Fgd1P52734 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Fgd1P52734 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Fgd1P52734 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Fgd1P52734 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Fgd1P52734 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Fgd1P52734 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Fgd1P52734 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Fgd1P52734 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Fgd1P52734 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Fgd1P52734 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Fgd1P52734 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Fgd1P52734 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Fgd1P52734 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Fgd1P52734 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Fgd1P52734 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Fgd1P52734 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Fgd1P52734 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Fgd1P52734 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Fgd1P52734 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Fgd1P52734 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Fgd1P52734 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Fgd1P52734 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Fgd1P52734 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Fgd1P52734 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Fgd1P52734 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Fgd1P52734 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Fgd1P52734 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Fgd1P52734 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Fgd1P52734 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Fgd1P52734 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Fgd1P52734 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Fgd1P52734 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Fgd1P52734 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Fgd1P52734 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Fgd1P52734 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Fgd1P52734 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Fgd1P52734 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Fgd1P52734 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Fgd1P52734 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Fgd1P52734 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Fgd1P52734 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Fgd1P52734 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Fgd1P52734 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Fgd1P52734 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms