Protein–RNA interactions for Protein: P51642

Cntf, Ciliary neurotrophic factor, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CntfP51642 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CntfP51642 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CntfP51642 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CntfP51642 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CntfP51642 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CntfP51642 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CntfP51642 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CntfP51642 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CntfP51642 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CntfP51642 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CntfP51642 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CntfP51642 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CntfP51642 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CntfP51642 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CntfP51642 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CntfP51642 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CntfP51642 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CntfP51642 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CntfP51642 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CntfP51642 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CntfP51642 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CntfP51642 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CntfP51642 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CntfP51642 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CntfP51642 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CntfP51642 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CntfP51642 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CntfP51642 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CntfP51642 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CntfP51642 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CntfP51642 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CntfP51642 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CntfP51642 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CntfP51642 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CntfP51642 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CntfP51642 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CntfP51642 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CntfP51642 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CntfP51642 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CntfP51642 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CntfP51642 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CntfP51642 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CntfP51642 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CntfP51642 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CntfP51642 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CntfP51642 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
CntfP51642 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CntfP51642 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CntfP51642 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CntfP51642 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CntfP51642 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CntfP51642 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CntfP51642 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CntfP51642 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
CntfP51642 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CntfP51642 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CntfP51642 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CntfP51642 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CntfP51642 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CntfP51642 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CntfP51642 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CntfP51642 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CntfP51642 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
CntfP51642 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CntfP51642 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
CntfP51642 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CntfP51642 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CntfP51642 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CntfP51642 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CntfP51642 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CntfP51642 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CntfP51642 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CntfP51642 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CntfP51642 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CntfP51642 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CntfP51642 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CntfP51642 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CntfP51642 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CntfP51642 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CntfP51642 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CntfP51642 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CntfP51642 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
CntfP51642 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
CntfP51642 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CntfP51642 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CntfP51642 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CntfP51642 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
CntfP51642 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CntfP51642 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CntfP51642 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CntfP51642 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
CntfP51642 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
CntfP51642 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
CntfP51642 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CntfP51642 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CntfP51642 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CntfP51642 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CntfP51642 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CntfP51642 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CntfP51642 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.5 ms