Protein–RNA interactions for Protein: P51450

Rorc, Nuclear receptor ROR-gamma, mousemouse

Predictions only

Length 516 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RorcP51450 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RorcP51450 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RorcP51450 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RorcP51450 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RorcP51450 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RorcP51450 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RorcP51450 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RorcP51450 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RorcP51450 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RorcP51450 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RorcP51450 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RorcP51450 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RorcP51450 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
RorcP51450 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
RorcP51450 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
RorcP51450 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
RorcP51450 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
RorcP51450 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RorcP51450 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RorcP51450 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC15.08■□□□□ 0
RorcP51450 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RorcP51450 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
RorcP51450 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
RorcP51450 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RorcP51450 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RorcP51450 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RorcP51450 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RorcP51450 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RorcP51450 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
RorcP51450 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
RorcP51450 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RorcP51450 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RorcP51450 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
RorcP51450 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RorcP51450 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RorcP51450 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
RorcP51450 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
RorcP51450 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RorcP51450 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
RorcP51450 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RorcP51450 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RorcP51450 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RorcP51450 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RorcP51450 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RorcP51450 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
RorcP51450 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RorcP51450 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RorcP51450 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
RorcP51450 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RorcP51450 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RorcP51450 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RorcP51450 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RorcP51450 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RorcP51450 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RorcP51450 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RorcP51450 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RorcP51450 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RorcP51450 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RorcP51450 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RorcP51450 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
RorcP51450 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RorcP51450 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RorcP51450 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
RorcP51450 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RorcP51450 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RorcP51450 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RorcP51450 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
RorcP51450 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RorcP51450 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RorcP51450 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RorcP51450 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RorcP51450 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RorcP51450 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RorcP51450 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
RorcP51450 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
RorcP51450 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
RorcP51450 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
RorcP51450 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
RorcP51450 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
RorcP51450 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RorcP51450 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RorcP51450 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
RorcP51450 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RorcP51450 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC15.05■□□□□ -0
RorcP51450 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RorcP51450 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RorcP51450 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RorcP51450 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RorcP51450 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RorcP51450 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RorcP51450 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
RorcP51450 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RorcP51450 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
RorcP51450 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RorcP51450 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RorcP51450 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC15.04■□□□□ -0
RorcP51450 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
RorcP51450 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC15.04■□□□□ -0
RorcP51450 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RorcP51450 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms