Protein–RNA interactions for Protein: P51125

Cast, Calpastatin, mousemouse

Predictions only

Length 788 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CastP51125 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CastP51125 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CastP51125 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CastP51125 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CastP51125 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CastP51125 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CastP51125 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CastP51125 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CastP51125 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
CastP51125 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CastP51125 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CastP51125 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CastP51125 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CastP51125 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CastP51125 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CastP51125 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CastP51125 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CastP51125 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CastP51125 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CastP51125 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CastP51125 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
CastP51125 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
CastP51125 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CastP51125 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
CastP51125 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CastP51125 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CastP51125 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CastP51125 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CastP51125 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CastP51125 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CastP51125 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CastP51125 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CastP51125 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CastP51125 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CastP51125 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CastP51125 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
CastP51125 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CastP51125 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CastP51125 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CastP51125 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CastP51125 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CastP51125 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CastP51125 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CastP51125 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CastP51125 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CastP51125 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
CastP51125 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CastP51125 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CastP51125 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CastP51125 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CastP51125 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CastP51125 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CastP51125 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CastP51125 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CastP51125 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CastP51125 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CastP51125 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CastP51125 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CastP51125 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CastP51125 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CastP51125 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CastP51125 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CastP51125 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CastP51125 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CastP51125 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CastP51125 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
CastP51125 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CastP51125 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CastP51125 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CastP51125 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CastP51125 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CastP51125 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CastP51125 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CastP51125 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CastP51125 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CastP51125 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CastP51125 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CastP51125 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CastP51125 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CastP51125 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CastP51125 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CastP51125 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CastP51125 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CastP51125 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
CastP51125 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CastP51125 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CastP51125 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CastP51125 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CastP51125 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
CastP51125 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CastP51125 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CastP51125 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CastP51125 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
CastP51125 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CastP51125 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
CastP51125 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CastP51125 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
CastP51125 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CastP51125 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CastP51125 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.3 ms