Protein–RNA interactions for Protein: P50716

Defa-rs12, Alpha-defensin-related sequence 12, mousemouse

Predictions only

Length 91 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa-rs12P50716 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Defa-rs12P50716 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Defa-rs12P50716 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Defa-rs12P50716 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Defa-rs12P50716 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Defa-rs12P50716 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Defa-rs12P50716 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Defa-rs12P50716 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Defa-rs12P50716 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Defa-rs12P50716 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Defa-rs12P50716 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Defa-rs12P50716 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Defa-rs12P50716 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Defa-rs12P50716 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Defa-rs12P50716 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Defa-rs12P50716 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Defa-rs12P50716 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Defa-rs12P50716 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Defa-rs12P50716 9230110C19Rik-202ENSMUST00000215478 533 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Defa-rs12P50716 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Defa-rs12P50716 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Defa-rs12P50716 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Defa-rs12P50716 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Defa-rs12P50716 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Defa-rs12P50716 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Defa-rs12P50716 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Defa-rs12P50716 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Defa-rs12P50716 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Defa-rs12P50716 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Defa-rs12P50716 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Defa-rs12P50716 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Defa-rs12P50716 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Defa-rs12P50716 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Defa-rs12P50716 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Defa-rs12P50716 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Defa-rs12P50716 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Defa-rs12P50716 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Defa-rs12P50716 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Defa-rs12P50716 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Defa-rs12P50716 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Defa-rs12P50716 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Defa-rs12P50716 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Defa-rs12P50716 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Defa-rs12P50716 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Defa-rs12P50716 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Defa-rs12P50716 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Defa-rs12P50716 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Defa-rs12P50716 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Defa-rs12P50716 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Defa-rs12P50716 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Defa-rs12P50716 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Defa-rs12P50716 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Defa-rs12P50716 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Defa-rs12P50716 Gm15201-201ENSMUST00000136472 1210 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Defa-rs12P50716 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Defa-rs12P50716 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Defa-rs12P50716 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Defa-rs12P50716 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Defa-rs12P50716 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Defa-rs12P50716 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Defa-rs12P50716 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Defa-rs12P50716 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Defa-rs12P50716 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Defa-rs12P50716 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Defa-rs12P50716 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Defa-rs12P50716 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Defa-rs12P50716 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Defa-rs12P50716 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Defa-rs12P50716 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Defa-rs12P50716 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Defa-rs12P50716 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Defa-rs12P50716 Gm31816-201ENSMUST00000209388 1294 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Defa-rs12P50716 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Defa-rs12P50716 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Defa-rs12P50716 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Defa-rs12P50716 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Defa-rs12P50716 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Defa-rs12P50716 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Defa-rs12P50716 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Defa-rs12P50716 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Defa-rs12P50716 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Defa-rs12P50716 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Defa-rs12P50716 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Defa-rs12P50716 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Defa-rs12P50716 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Defa-rs12P50716 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Defa-rs12P50716 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Defa-rs12P50716 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Defa-rs12P50716 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Defa-rs12P50716 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Defa-rs12P50716 Arhgef33-209ENSMUST00000225223 714 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Defa-rs12P50716 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Defa-rs12P50716 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Defa-rs12P50716 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Defa-rs12P50716 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Defa-rs12P50716 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Defa-rs12P50716 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Defa-rs12P50716 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Defa-rs12P50716 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Defa-rs12P50716 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.1 ms