Protein–RNA interactions for Protein: P50637

Tspo, Translocator protein, mousemouse

Predictions only

Length 169 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TspoP50637 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
TspoP50637 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
TspoP50637 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
TspoP50637 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
TspoP50637 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
TspoP50637 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
TspoP50637 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
TspoP50637 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
TspoP50637 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
TspoP50637 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
TspoP50637 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
TspoP50637 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
TspoP50637 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
TspoP50637 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
TspoP50637 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
TspoP50637 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
TspoP50637 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
TspoP50637 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
TspoP50637 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
TspoP50637 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
TspoP50637 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
TspoP50637 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
TspoP50637 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
TspoP50637 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
TspoP50637 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
TspoP50637 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
TspoP50637 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
TspoP50637 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
TspoP50637 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
TspoP50637 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
TspoP50637 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
TspoP50637 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
TspoP50637 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
TspoP50637 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
TspoP50637 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
TspoP50637 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
TspoP50637 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
TspoP50637 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
TspoP50637 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
TspoP50637 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
TspoP50637 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
TspoP50637 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
TspoP50637 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
TspoP50637 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
TspoP50637 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
TspoP50637 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
TspoP50637 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
TspoP50637 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
TspoP50637 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC14.11□□□□□ -0.15
TspoP50637 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
TspoP50637 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
TspoP50637 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
TspoP50637 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
TspoP50637 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
TspoP50637 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
TspoP50637 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
TspoP50637 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
TspoP50637 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
TspoP50637 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
TspoP50637 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
TspoP50637 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
TspoP50637 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
TspoP50637 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
TspoP50637 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
TspoP50637 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
TspoP50637 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
TspoP50637 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
TspoP50637 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
TspoP50637 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
TspoP50637 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
TspoP50637 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
TspoP50637 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
TspoP50637 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
TspoP50637 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
TspoP50637 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
TspoP50637 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
TspoP50637 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
TspoP50637 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
TspoP50637 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
TspoP50637 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
TspoP50637 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
TspoP50637 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
TspoP50637 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
TspoP50637 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC14.1□□□□□ -0.15
TspoP50637 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
TspoP50637 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
TspoP50637 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
TspoP50637 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
TspoP50637 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
TspoP50637 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
TspoP50637 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
TspoP50637 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
TspoP50637 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
TspoP50637 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
TspoP50637 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
TspoP50637 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
TspoP50637 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
TspoP50637 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
TspoP50637 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
TspoP50637 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
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