Protein–RNA interactions for Protein: P50608

Fmod, Fibromodulin, mousemouse

Predictions only

Length 376 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FmodP50608 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
FmodP50608 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
FmodP50608 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
FmodP50608 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
FmodP50608 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
FmodP50608 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
FmodP50608 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
FmodP50608 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.23
FmodP50608 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
FmodP50608 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
FmodP50608 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
FmodP50608 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
FmodP50608 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
FmodP50608 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
FmodP50608 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
FmodP50608 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
FmodP50608 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
FmodP50608 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
FmodP50608 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
FmodP50608 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
FmodP50608 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
FmodP50608 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
FmodP50608 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
FmodP50608 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
FmodP50608 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
FmodP50608 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
FmodP50608 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
FmodP50608 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
FmodP50608 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
FmodP50608 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
FmodP50608 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
FmodP50608 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
FmodP50608 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
FmodP50608 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
FmodP50608 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
FmodP50608 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
FmodP50608 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
FmodP50608 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
FmodP50608 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
FmodP50608 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
FmodP50608 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
FmodP50608 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
FmodP50608 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
FmodP50608 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
FmodP50608 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
FmodP50608 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
FmodP50608 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
FmodP50608 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
FmodP50608 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
FmodP50608 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
FmodP50608 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
FmodP50608 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
FmodP50608 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
FmodP50608 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
FmodP50608 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
FmodP50608 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
FmodP50608 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
FmodP50608 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
FmodP50608 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
FmodP50608 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
FmodP50608 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
FmodP50608 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
FmodP50608 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
FmodP50608 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
FmodP50608 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
FmodP50608 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
FmodP50608 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
FmodP50608 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
FmodP50608 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
FmodP50608 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
FmodP50608 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
FmodP50608 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
FmodP50608 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
FmodP50608 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
FmodP50608 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
FmodP50608 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
FmodP50608 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
FmodP50608 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
FmodP50608 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
FmodP50608 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
FmodP50608 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
FmodP50608 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
FmodP50608 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
FmodP50608 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
FmodP50608 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
FmodP50608 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
FmodP50608 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
FmodP50608 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
FmodP50608 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
FmodP50608 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
FmodP50608 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
FmodP50608 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
FmodP50608 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
FmodP50608 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
FmodP50608 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC13.61□□□□□ -0.23
FmodP50608 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
FmodP50608 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
FmodP50608 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
FmodP50608 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
FmodP50608 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.8 ms