Protein–RNA interactions for Protein: P50405

Sftpb, Pulmonary surfactant-associated protein B, mousemouse

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SftpbP50405 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SftpbP50405 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SftpbP50405 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SftpbP50405 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SftpbP50405 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SftpbP50405 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SftpbP50405 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SftpbP50405 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SftpbP50405 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SftpbP50405 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SftpbP50405 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SftpbP50405 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SftpbP50405 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SftpbP50405 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
SftpbP50405 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SftpbP50405 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SftpbP50405 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SftpbP50405 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SftpbP50405 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SftpbP50405 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SftpbP50405 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SftpbP50405 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SftpbP50405 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SftpbP50405 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SftpbP50405 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SftpbP50405 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SftpbP50405 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SftpbP50405 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SftpbP50405 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SftpbP50405 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SftpbP50405 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SftpbP50405 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SftpbP50405 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SftpbP50405 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SftpbP50405 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SftpbP50405 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SftpbP50405 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
SftpbP50405 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SftpbP50405 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SftpbP50405 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SftpbP50405 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SftpbP50405 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SftpbP50405 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SftpbP50405 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SftpbP50405 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SftpbP50405 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SftpbP50405 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SftpbP50405 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SftpbP50405 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SftpbP50405 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SftpbP50405 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SftpbP50405 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SftpbP50405 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SftpbP50405 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SftpbP50405 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SftpbP50405 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SftpbP50405 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SftpbP50405 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SftpbP50405 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SftpbP50405 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SftpbP50405 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SftpbP50405 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SftpbP50405 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SftpbP50405 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SftpbP50405 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SftpbP50405 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SftpbP50405 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SftpbP50405 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SftpbP50405 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SftpbP50405 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SftpbP50405 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SftpbP50405 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SftpbP50405 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SftpbP50405 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SftpbP50405 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SftpbP50405 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SftpbP50405 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SftpbP50405 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SftpbP50405 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SftpbP50405 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SftpbP50405 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SftpbP50405 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
SftpbP50405 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SftpbP50405 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SftpbP50405 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SftpbP50405 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SftpbP50405 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SftpbP50405 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SftpbP50405 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SftpbP50405 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SftpbP50405 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SftpbP50405 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SftpbP50405 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SftpbP50405 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SftpbP50405 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
SftpbP50405 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SftpbP50405 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SftpbP50405 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SftpbP50405 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SftpbP50405 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.7 ms