Protein–RNA interactions for Protein: P49813

Tmod1, Tropomodulin-1, mousemouse

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Length 359 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmod1P49813 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tmod1P49813 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tmod1P49813 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tmod1P49813 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Tmod1P49813 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tmod1P49813 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tmod1P49813 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tmod1P49813 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tmod1P49813 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tmod1P49813 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tmod1P49813 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tmod1P49813 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tmod1P49813 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tmod1P49813 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tmod1P49813 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tmod1P49813 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tmod1P49813 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tmod1P49813 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Tmod1P49813 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tmod1P49813 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tmod1P49813 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tmod1P49813 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tmod1P49813 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tmod1P49813 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tmod1P49813 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tmod1P49813 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tmod1P49813 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tmod1P49813 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tmod1P49813 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tmod1P49813 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tmod1P49813 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tmod1P49813 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tmod1P49813 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tmod1P49813 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tmod1P49813 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tmod1P49813 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Tmod1P49813 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Tmod1P49813 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tmod1P49813 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tmod1P49813 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Tmod1P49813 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tmod1P49813 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tmod1P49813 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tmod1P49813 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tmod1P49813 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tmod1P49813 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tmod1P49813 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tmod1P49813 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tmod1P49813 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tmod1P49813 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tmod1P49813 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tmod1P49813 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tmod1P49813 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tmod1P49813 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tmod1P49813 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tmod1P49813 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tmod1P49813 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tmod1P49813 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tmod1P49813 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tmod1P49813 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tmod1P49813 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tmod1P49813 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tmod1P49813 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tmod1P49813 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tmod1P49813 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Tmod1P49813 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Tmod1P49813 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Tmod1P49813 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Tmod1P49813 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Tmod1P49813 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Tmod1P49813 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Tmod1P49813 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Tmod1P49813 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Tmod1P49813 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Tmod1P49813 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Tmod1P49813 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Tmod1P49813 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Tmod1P49813 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Tmod1P49813 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC18.52■□□□□ 0.55
Tmod1P49813 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tmod1P49813 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tmod1P49813 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tmod1P49813 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tmod1P49813 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tmod1P49813 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tmod1P49813 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tmod1P49813 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tmod1P49813 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tmod1P49813 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tmod1P49813 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tmod1P49813 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Tmod1P49813 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Tmod1P49813 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tmod1P49813 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tmod1P49813 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tmod1P49813 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tmod1P49813 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tmod1P49813 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tmod1P49813 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tmod1P49813 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
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