Protein–RNA interactions for Protein: P49615

Cdk5, Cyclin-dependent-like kinase 5, mousemouse

Predictions only

Length 292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdk5P49615 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cdk5P49615 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cdk5P49615 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cdk5P49615 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cdk5P49615 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cdk5P49615 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cdk5P49615 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cdk5P49615 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cdk5P49615 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cdk5P49615 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Cdk5P49615 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Cdk5P49615 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Cdk5P49615 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Cdk5P49615 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cdk5P49615 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cdk5P49615 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cdk5P49615 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cdk5P49615 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cdk5P49615 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cdk5P49615 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cdk5P49615 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cdk5P49615 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cdk5P49615 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cdk5P49615 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cdk5P49615 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cdk5P49615 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cdk5P49615 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Cdk5P49615 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cdk5P49615 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cdk5P49615 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cdk5P49615 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cdk5P49615 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cdk5P49615 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Cdk5P49615 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cdk5P49615 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cdk5P49615 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cdk5P49615 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cdk5P49615 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cdk5P49615 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cdk5P49615 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cdk5P49615 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cdk5P49615 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cdk5P49615 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cdk5P49615 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cdk5P49615 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cdk5P49615 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cdk5P49615 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cdk5P49615 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cdk5P49615 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cdk5P49615 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cdk5P49615 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cdk5P49615 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cdk5P49615 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cdk5P49615 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cdk5P49615 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cdk5P49615 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cdk5P49615 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cdk5P49615 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cdk5P49615 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cdk5P49615 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cdk5P49615 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cdk5P49615 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cdk5P49615 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cdk5P49615 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cdk5P49615 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cdk5P49615 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cdk5P49615 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cdk5P49615 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Cdk5P49615 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cdk5P49615 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Cdk5P49615 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cdk5P49615 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cdk5P49615 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cdk5P49615 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cdk5P49615 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cdk5P49615 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cdk5P49615 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cdk5P49615 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cdk5P49615 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cdk5P49615 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cdk5P49615 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cdk5P49615 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cdk5P49615 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cdk5P49615 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cdk5P49615 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cdk5P49615 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cdk5P49615 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cdk5P49615 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cdk5P49615 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cdk5P49615 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cdk5P49615 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cdk5P49615 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cdk5P49615 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cdk5P49615 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cdk5P49615 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cdk5P49615 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Cdk5P49615 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cdk5P49615 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cdk5P49615 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cdk5P49615 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.1 ms