Protein–RNA interactions for Protein: P49446

Ptpre, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase epsilon, mousemouse

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Length 699 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtpreP49446 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
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PtpreP49446 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
PtpreP49446 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
PtpreP49446 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
PtpreP49446 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
PtpreP49446 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
PtpreP49446 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
PtpreP49446 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
PtpreP49446 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
PtpreP49446 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
PtpreP49446 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
PtpreP49446 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
PtpreP49446 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
PtpreP49446 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PtpreP49446 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PtpreP49446 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PtpreP49446 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PtpreP49446 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PtpreP49446 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PtpreP49446 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
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PtpreP49446 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
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PtpreP49446 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
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PtpreP49446 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
PtpreP49446 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PtpreP49446 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PtpreP49446 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
PtpreP49446 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PtpreP49446 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PtpreP49446 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PtpreP49446 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
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PtpreP49446 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PtpreP49446 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
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PtpreP49446 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
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PtpreP49446 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PtpreP49446 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PtpreP49446 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
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PtpreP49446 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
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PtpreP49446 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PtpreP49446 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PtpreP49446 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PtpreP49446 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PtpreP49446 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PtpreP49446 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PtpreP49446 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PtpreP49446 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PtpreP49446 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PtpreP49446 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PtpreP49446 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PtpreP49446 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
PtpreP49446 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PtpreP49446 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
PtpreP49446 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PtpreP49446 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
PtpreP49446 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PtpreP49446 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PtpreP49446 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PtpreP49446 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PtpreP49446 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PtpreP49446 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PtpreP49446 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PtpreP49446 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PtpreP49446 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PtpreP49446 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
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