Protein–RNA interactions for Protein: P48030

Tgfa, Protransforming growth factor alpha, mousemouse

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Length 159 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TgfaP48030 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
TgfaP48030 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
TgfaP48030 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
TgfaP48030 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
TgfaP48030 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
TgfaP48030 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
TgfaP48030 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
TgfaP48030 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
TgfaP48030 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
TgfaP48030 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
TgfaP48030 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
TgfaP48030 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
TgfaP48030 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
TgfaP48030 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
TgfaP48030 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
TgfaP48030 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
TgfaP48030 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
TgfaP48030 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
TgfaP48030 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
TgfaP48030 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
TgfaP48030 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
TgfaP48030 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
TgfaP48030 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
TgfaP48030 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
TgfaP48030 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
TgfaP48030 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
TgfaP48030 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
TgfaP48030 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
TgfaP48030 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
TgfaP48030 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
TgfaP48030 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
TgfaP48030 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
TgfaP48030 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
TgfaP48030 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
TgfaP48030 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
TgfaP48030 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.09
TgfaP48030 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
TgfaP48030 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
TgfaP48030 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
TgfaP48030 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
TgfaP48030 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
TgfaP48030 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
TgfaP48030 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
TgfaP48030 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
TgfaP48030 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
TgfaP48030 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
TgfaP48030 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
TgfaP48030 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
TgfaP48030 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
TgfaP48030 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
TgfaP48030 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
TgfaP48030 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
TgfaP48030 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
TgfaP48030 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
TgfaP48030 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
TgfaP48030 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
TgfaP48030 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
TgfaP48030 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
TgfaP48030 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
TgfaP48030 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
TgfaP48030 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
TgfaP48030 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
TgfaP48030 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
TgfaP48030 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
TgfaP48030 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
TgfaP48030 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
TgfaP48030 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TgfaP48030 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TgfaP48030 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TgfaP48030 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
TgfaP48030 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TgfaP48030 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TgfaP48030 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TgfaP48030 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TgfaP48030 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TgfaP48030 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TgfaP48030 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TgfaP48030 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TgfaP48030 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TgfaP48030 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
TgfaP48030 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TgfaP48030 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
TgfaP48030 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
TgfaP48030 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
TgfaP48030 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TgfaP48030 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TgfaP48030 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TgfaP48030 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TgfaP48030 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TgfaP48030 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TgfaP48030 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
TgfaP48030 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TgfaP48030 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TgfaP48030 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TgfaP48030 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TgfaP48030 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TgfaP48030 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TgfaP48030 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TgfaP48030 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TgfaP48030 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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