Protein–RNA interactions for Protein: P47962

Rpl5, 60S ribosomal protein L5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 297 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl5P47962 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rpl5P47962 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rpl5P47962 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rpl5P47962 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rpl5P47962 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rpl5P47962 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rpl5P47962 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rpl5P47962 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rpl5P47962 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rpl5P47962 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rpl5P47962 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rpl5P47962 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Rpl5P47962 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Rpl5P47962 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Rpl5P47962 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Rpl5P47962 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Rpl5P47962 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Rpl5P47962 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rpl5P47962 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rpl5P47962 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rpl5P47962 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rpl5P47962 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rpl5P47962 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rpl5P47962 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rpl5P47962 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rpl5P47962 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Rpl5P47962 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rpl5P47962 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rpl5P47962 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rpl5P47962 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rpl5P47962 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rpl5P47962 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rpl5P47962 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rpl5P47962 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rpl5P47962 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rpl5P47962 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rpl5P47962 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rpl5P47962 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Rpl5P47962 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rpl5P47962 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rpl5P47962 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rpl5P47962 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rpl5P47962 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rpl5P47962 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rpl5P47962 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rpl5P47962 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rpl5P47962 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rpl5P47962 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rpl5P47962 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rpl5P47962 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rpl5P47962 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rpl5P47962 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Rpl5P47962 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rpl5P47962 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rpl5P47962 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rpl5P47962 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rpl5P47962 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rpl5P47962 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rpl5P47962 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rpl5P47962 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Rpl5P47962 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rpl5P47962 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rpl5P47962 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rpl5P47962 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rpl5P47962 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rpl5P47962 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rpl5P47962 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rpl5P47962 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rpl5P47962 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rpl5P47962 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rpl5P47962 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rpl5P47962 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rpl5P47962 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rpl5P47962 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rpl5P47962 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rpl5P47962 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rpl5P47962 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rpl5P47962 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rpl5P47962 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rpl5P47962 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rpl5P47962 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rpl5P47962 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rpl5P47962 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rpl5P47962 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rpl5P47962 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rpl5P47962 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rpl5P47962 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rpl5P47962 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Rpl5P47962 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rpl5P47962 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rpl5P47962 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rpl5P47962 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rpl5P47962 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rpl5P47962 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rpl5P47962 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Rpl5P47962 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rpl5P47962 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rpl5P47962 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rpl5P47962 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rpl5P47962 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms