Protein–RNA interactions for Protein: P47758

Srprb, Signal recognition particle receptor subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 269 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrprbP47758 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SrprbP47758 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SrprbP47758 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SrprbP47758 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SrprbP47758 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SrprbP47758 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SrprbP47758 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SrprbP47758 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SrprbP47758 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SrprbP47758 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
SrprbP47758 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SrprbP47758 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SrprbP47758 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SrprbP47758 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SrprbP47758 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SrprbP47758 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SrprbP47758 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SrprbP47758 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SrprbP47758 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SrprbP47758 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SrprbP47758 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SrprbP47758 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SrprbP47758 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SrprbP47758 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SrprbP47758 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SrprbP47758 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SrprbP47758 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SrprbP47758 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SrprbP47758 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SrprbP47758 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SrprbP47758 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SrprbP47758 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SrprbP47758 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SrprbP47758 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SrprbP47758 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SrprbP47758 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SrprbP47758 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SrprbP47758 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SrprbP47758 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SrprbP47758 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SrprbP47758 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SrprbP47758 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
SrprbP47758 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SrprbP47758 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SrprbP47758 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SrprbP47758 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SrprbP47758 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SrprbP47758 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SrprbP47758 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SrprbP47758 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
SrprbP47758 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
SrprbP47758 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
SrprbP47758 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
SrprbP47758 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SrprbP47758 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SrprbP47758 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SrprbP47758 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
SrprbP47758 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SrprbP47758 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SrprbP47758 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SrprbP47758 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SrprbP47758 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
SrprbP47758 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
SrprbP47758 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SrprbP47758 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SrprbP47758 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC19.26■□□□□ 0.67
SrprbP47758 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
SrprbP47758 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
SrprbP47758 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
SrprbP47758 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
SrprbP47758 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
SrprbP47758 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SrprbP47758 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC19.26■□□□□ 0.67
SrprbP47758 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SrprbP47758 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC19.26■□□□□ 0.67
SrprbP47758 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SrprbP47758 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SrprbP47758 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
SrprbP47758 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SrprbP47758 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC19.26■□□□□ 0.67
SrprbP47758 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC19.26■□□□□ 0.67
SrprbP47758 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
SrprbP47758 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SrprbP47758 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SrprbP47758 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SrprbP47758 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SrprbP47758 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SrprbP47758 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SrprbP47758 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SrprbP47758 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SrprbP47758 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SrprbP47758 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SrprbP47758 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
SrprbP47758 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SrprbP47758 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SrprbP47758 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SrprbP47758 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SrprbP47758 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SrprbP47758 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SrprbP47758 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.3 ms