Protein–RNA interactions for Protein: P46660

Ina, Alpha-internexin, mousemouse

Predictions only

Length 501 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
InaP46660 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
InaP46660 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
InaP46660 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
InaP46660 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
InaP46660 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
InaP46660 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
InaP46660 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
InaP46660 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
InaP46660 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
InaP46660 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
InaP46660 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
InaP46660 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
InaP46660 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
InaP46660 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
InaP46660 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
InaP46660 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
InaP46660 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
InaP46660 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
InaP46660 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
InaP46660 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
InaP46660 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
InaP46660 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
InaP46660 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
InaP46660 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
InaP46660 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
InaP46660 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
InaP46660 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
InaP46660 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
InaP46660 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
InaP46660 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
InaP46660 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
InaP46660 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
InaP46660 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
InaP46660 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
InaP46660 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
InaP46660 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
InaP46660 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
InaP46660 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
InaP46660 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
InaP46660 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
InaP46660 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
InaP46660 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
InaP46660 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
InaP46660 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
InaP46660 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
InaP46660 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
InaP46660 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
InaP46660 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
InaP46660 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
InaP46660 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
InaP46660 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
InaP46660 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
InaP46660 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
InaP46660 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
InaP46660 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
InaP46660 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
InaP46660 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
InaP46660 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
InaP46660 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
InaP46660 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
InaP46660 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
InaP46660 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
InaP46660 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
InaP46660 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
InaP46660 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
InaP46660 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
InaP46660 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
InaP46660 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
InaP46660 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
InaP46660 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
InaP46660 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
InaP46660 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
InaP46660 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
InaP46660 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
InaP46660 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
InaP46660 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
InaP46660 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
InaP46660 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
InaP46660 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
InaP46660 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
InaP46660 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
InaP46660 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
InaP46660 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
InaP46660 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
InaP46660 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
InaP46660 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
InaP46660 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
InaP46660 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
InaP46660 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
InaP46660 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
InaP46660 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
InaP46660 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
InaP46660 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
InaP46660 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
InaP46660 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
InaP46660 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
InaP46660 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
InaP46660 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
InaP46660 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
InaP46660 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.1 ms