Protein–RNA interactions for Protein: P46638

Rab11b, Ras-related protein Rab-11B, mousemouse

Predictions only

Length 218 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab11bP46638 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rab11bP46638 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rab11bP46638 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rab11bP46638 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rab11bP46638 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rab11bP46638 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rab11bP46638 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rab11bP46638 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rab11bP46638 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rab11bP46638 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rab11bP46638 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rab11bP46638 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rab11bP46638 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rab11bP46638 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rab11bP46638 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rab11bP46638 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rab11bP46638 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rab11bP46638 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Rab11bP46638 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rab11bP46638 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rab11bP46638 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rab11bP46638 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rab11bP46638 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rab11bP46638 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rab11bP46638 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rab11bP46638 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rab11bP46638 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rab11bP46638 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rab11bP46638 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rab11bP46638 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rab11bP46638 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rab11bP46638 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rab11bP46638 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rab11bP46638 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rab11bP46638 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rab11bP46638 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rab11bP46638 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rab11bP46638 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rab11bP46638 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rab11bP46638 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rab11bP46638 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rab11bP46638 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rab11bP46638 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Rab11bP46638 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rab11bP46638 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rab11bP46638 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rab11bP46638 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Rab11bP46638 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rab11bP46638 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rab11bP46638 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rab11bP46638 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rab11bP46638 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rab11bP46638 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rab11bP46638 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rab11bP46638 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rab11bP46638 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rab11bP46638 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rab11bP46638 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rab11bP46638 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rab11bP46638 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rab11bP46638 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rab11bP46638 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rab11bP46638 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rab11bP46638 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rab11bP46638 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rab11bP46638 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rab11bP46638 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rab11bP46638 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rab11bP46638 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Rab11bP46638 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rab11bP46638 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rab11bP46638 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rab11bP46638 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rab11bP46638 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rab11bP46638 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Rab11bP46638 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rab11bP46638 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rab11bP46638 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rab11bP46638 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rab11bP46638 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rab11bP46638 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rab11bP46638 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rab11bP46638 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Rab11bP46638 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rab11bP46638 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rab11bP46638 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rab11bP46638 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rab11bP46638 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rab11bP46638 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Rab11bP46638 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rab11bP46638 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rab11bP46638 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Rab11bP46638 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Rab11bP46638 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rab11bP46638 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rab11bP46638 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rab11bP46638 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rab11bP46638 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rab11bP46638 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rab11bP46638 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.6 ms