Protein–RNA interactions for Protein: P43488

Tnfsf4, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 4, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfsf4P43488 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tnfsf4P43488 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tnfsf4P43488 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tnfsf4P43488 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tnfsf4P43488 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tnfsf4P43488 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tnfsf4P43488 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tnfsf4P43488 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tnfsf4P43488 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tnfsf4P43488 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tnfsf4P43488 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tnfsf4P43488 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tnfsf4P43488 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tnfsf4P43488 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tnfsf4P43488 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tnfsf4P43488 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tnfsf4P43488 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tnfsf4P43488 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tnfsf4P43488 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Tnfsf4P43488 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tnfsf4P43488 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tnfsf4P43488 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tnfsf4P43488 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tnfsf4P43488 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tnfsf4P43488 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tnfsf4P43488 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tnfsf4P43488 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tnfsf4P43488 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tnfsf4P43488 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tnfsf4P43488 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tnfsf4P43488 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tnfsf4P43488 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tnfsf4P43488 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Tnfsf4P43488 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tnfsf4P43488 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Tnfsf4P43488 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tnfsf4P43488 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tnfsf4P43488 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tnfsf4P43488 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tnfsf4P43488 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tnfsf4P43488 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tnfsf4P43488 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tnfsf4P43488 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tnfsf4P43488 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tnfsf4P43488 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tnfsf4P43488 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tnfsf4P43488 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tnfsf4P43488 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tnfsf4P43488 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tnfsf4P43488 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tnfsf4P43488 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tnfsf4P43488 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tnfsf4P43488 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tnfsf4P43488 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tnfsf4P43488 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tnfsf4P43488 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tnfsf4P43488 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tnfsf4P43488 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tnfsf4P43488 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tnfsf4P43488 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tnfsf4P43488 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tnfsf4P43488 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tnfsf4P43488 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tnfsf4P43488 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tnfsf4P43488 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tnfsf4P43488 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tnfsf4P43488 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tnfsf4P43488 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tnfsf4P43488 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tnfsf4P43488 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Tnfsf4P43488 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tnfsf4P43488 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tnfsf4P43488 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tnfsf4P43488 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tnfsf4P43488 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tnfsf4P43488 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tnfsf4P43488 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Tnfsf4P43488 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tnfsf4P43488 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tnfsf4P43488 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tnfsf4P43488 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tnfsf4P43488 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tnfsf4P43488 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tnfsf4P43488 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tnfsf4P43488 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tnfsf4P43488 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tnfsf4P43488 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tnfsf4P43488 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tnfsf4P43488 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tnfsf4P43488 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tnfsf4P43488 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tnfsf4P43488 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tnfsf4P43488 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tnfsf4P43488 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Tnfsf4P43488 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Tnfsf4P43488 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Tnfsf4P43488 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Tnfsf4P43488 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tnfsf4P43488 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tnfsf4P43488 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.1 ms