Protein–RNA interactions for Protein: P43406

Itgav, Integrin alpha-V, mousemouse

Predictions only

Length 1,044 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ItgavP43406 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
ItgavP43406 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ItgavP43406 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ItgavP43406 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ItgavP43406 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ItgavP43406 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ItgavP43406 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ItgavP43406 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ItgavP43406 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ItgavP43406 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ItgavP43406 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ItgavP43406 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ItgavP43406 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ItgavP43406 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ItgavP43406 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ItgavP43406 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ItgavP43406 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ItgavP43406 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ItgavP43406 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ItgavP43406 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ItgavP43406 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ItgavP43406 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ItgavP43406 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ItgavP43406 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ItgavP43406 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ItgavP43406 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ItgavP43406 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
ItgavP43406 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ItgavP43406 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ItgavP43406 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ItgavP43406 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ItgavP43406 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ItgavP43406 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ItgavP43406 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ItgavP43406 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ItgavP43406 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
ItgavP43406 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ItgavP43406 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ItgavP43406 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ItgavP43406 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ItgavP43406 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ItgavP43406 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ItgavP43406 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ItgavP43406 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ItgavP43406 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ItgavP43406 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ItgavP43406 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ItgavP43406 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
ItgavP43406 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
ItgavP43406 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ItgavP43406 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ItgavP43406 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ItgavP43406 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ItgavP43406 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ItgavP43406 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ItgavP43406 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ItgavP43406 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
ItgavP43406 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ItgavP43406 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ItgavP43406 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ItgavP43406 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ItgavP43406 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ItgavP43406 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ItgavP43406 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ItgavP43406 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ItgavP43406 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ItgavP43406 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ItgavP43406 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ItgavP43406 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ItgavP43406 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ItgavP43406 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ItgavP43406 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ItgavP43406 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
ItgavP43406 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
ItgavP43406 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ItgavP43406 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ItgavP43406 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ItgavP43406 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ItgavP43406 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ItgavP43406 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ItgavP43406 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ItgavP43406 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.34
ItgavP43406 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
ItgavP43406 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ItgavP43406 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ItgavP43406 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ItgavP43406 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
ItgavP43406 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ItgavP43406 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ItgavP43406 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ItgavP43406 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ItgavP43406 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ItgavP43406 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ItgavP43406 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ItgavP43406 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ItgavP43406 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ItgavP43406 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ItgavP43406 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ItgavP43406 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ItgavP43406 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 139.2 ms