Protein–RNA interactions for Protein: P42580

Nkx1-2, NK1 transcription factor-related protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nkx1-2P42580 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Nkx1-2P42580 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Nkx1-2P42580 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Nkx1-2P42580 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Nkx1-2P42580 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Nkx1-2P42580 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Nkx1-2P42580 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
Nkx1-2P42580 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Nkx1-2P42580 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Nkx1-2P42580 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Nkx1-2P42580 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Nkx1-2P42580 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Nkx1-2P42580 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Nkx1-2P42580 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Nkx1-2P42580 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Nkx1-2P42580 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Nkx1-2P42580 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Nkx1-2P42580 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Nkx1-2P42580 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Nkx1-2P42580 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Nkx1-2P42580 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
Nkx1-2P42580 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Nkx1-2P42580 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Nkx1-2P42580 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Nkx1-2P42580 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Nkx1-2P42580 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Nkx1-2P42580 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
Nkx1-2P42580 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Nkx1-2P42580 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Nkx1-2P42580 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Nkx1-2P42580 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Nkx1-2P42580 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Nkx1-2P42580 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Nkx1-2P42580 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Nkx1-2P42580 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Nkx1-2P42580 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Nkx1-2P42580 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Nkx1-2P42580 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Nkx1-2P42580 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Nkx1-2P42580 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Nkx1-2P42580 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Nkx1-2P42580 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Nkx1-2P42580 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Nkx1-2P42580 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Nkx1-2P42580 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Nkx1-2P42580 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Nkx1-2P42580 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Nkx1-2P42580 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Nkx1-2P42580 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Nkx1-2P42580 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Nkx1-2P42580 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Nkx1-2P42580 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Nkx1-2P42580 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Nkx1-2P42580 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Nkx1-2P42580 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Nkx1-2P42580 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Nkx1-2P42580 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Nkx1-2P42580 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Nkx1-2P42580 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Nkx1-2P42580 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Nkx1-2P42580 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Nkx1-2P42580 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Nkx1-2P42580 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Nkx1-2P42580 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Nkx1-2P42580 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Nkx1-2P42580 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Nkx1-2P42580 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Nkx1-2P42580 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Nkx1-2P42580 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Nkx1-2P42580 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Nkx1-2P42580 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Nkx1-2P42580 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Nkx1-2P42580 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Nkx1-2P42580 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Nkx1-2P42580 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Nkx1-2P42580 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Nkx1-2P42580 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
Nkx1-2P42580 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Nkx1-2P42580 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Nkx1-2P42580 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Nkx1-2P42580 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
Nkx1-2P42580 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Nkx1-2P42580 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Nkx1-2P42580 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Nkx1-2P42580 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Nkx1-2P42580 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Nkx1-2P42580 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Nkx1-2P42580 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
Nkx1-2P42580 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Nkx1-2P42580 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Nkx1-2P42580 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Nkx1-2P42580 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Nkx1-2P42580 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Nkx1-2P42580 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Nkx1-2P42580 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Nkx1-2P42580 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Nkx1-2P42580 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Nkx1-2P42580 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Nkx1-2P42580 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Nkx1-2P42580 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms