Protein–RNA interactions for Protein: P41969

Elk1, ETS domain-containing protein Elk-1, mousemouse

Predictions only

Length 429 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Elk1P41969 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Elk1P41969 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Elk1P41969 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Elk1P41969 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Elk1P41969 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Elk1P41969 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Elk1P41969 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Elk1P41969 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Elk1P41969 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Elk1P41969 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Elk1P41969 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Elk1P41969 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Elk1P41969 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Elk1P41969 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Elk1P41969 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Elk1P41969 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Elk1P41969 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Elk1P41969 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Elk1P41969 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Elk1P41969 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Elk1P41969 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Elk1P41969 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Elk1P41969 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Elk1P41969 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Elk1P41969 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Elk1P41969 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Elk1P41969 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Elk1P41969 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Elk1P41969 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Elk1P41969 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Elk1P41969 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Elk1P41969 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Elk1P41969 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Elk1P41969 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Elk1P41969 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Elk1P41969 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Elk1P41969 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Elk1P41969 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Elk1P41969 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Elk1P41969 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Elk1P41969 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Elk1P41969 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Elk1P41969 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Elk1P41969 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Elk1P41969 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Elk1P41969 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Elk1P41969 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Elk1P41969 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Elk1P41969 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Elk1P41969 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Elk1P41969 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Elk1P41969 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Elk1P41969 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Elk1P41969 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Elk1P41969 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Elk1P41969 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Elk1P41969 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Elk1P41969 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Elk1P41969 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Elk1P41969 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Elk1P41969 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Elk1P41969 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Elk1P41969 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Elk1P41969 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Elk1P41969 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Elk1P41969 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Elk1P41969 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Elk1P41969 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Elk1P41969 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Elk1P41969 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Elk1P41969 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Elk1P41969 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Elk1P41969 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Elk1P41969 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Elk1P41969 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Elk1P41969 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Elk1P41969 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Elk1P41969 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Elk1P41969 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Elk1P41969 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Elk1P41969 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Elk1P41969 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Elk1P41969 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Elk1P41969 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Elk1P41969 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Elk1P41969 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Elk1P41969 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Elk1P41969 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Elk1P41969 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Elk1P41969 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Elk1P41969 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Elk1P41969 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Elk1P41969 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Elk1P41969 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Elk1P41969 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Elk1P41969 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Elk1P41969 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Elk1P41969 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Elk1P41969 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Elk1P41969 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 76.6 ms