Protein–RNA interactions for Protein: P41539

Tac1, Protachykinin-1, mousemouse

Predictions only

Length 130 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tac1P41539 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tac1P41539 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tac1P41539 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tac1P41539 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tac1P41539 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tac1P41539 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tac1P41539 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tac1P41539 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tac1P41539 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tac1P41539 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tac1P41539 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Tac1P41539 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tac1P41539 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tac1P41539 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tac1P41539 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tac1P41539 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tac1P41539 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tac1P41539 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tac1P41539 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tac1P41539 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tac1P41539 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tac1P41539 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tac1P41539 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tac1P41539 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tac1P41539 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tac1P41539 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tac1P41539 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tac1P41539 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tac1P41539 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tac1P41539 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Tac1P41539 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tac1P41539 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tac1P41539 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tac1P41539 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tac1P41539 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tac1P41539 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tac1P41539 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tac1P41539 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tac1P41539 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tac1P41539 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tac1P41539 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tac1P41539 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tac1P41539 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tac1P41539 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tac1P41539 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tac1P41539 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tac1P41539 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tac1P41539 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tac1P41539 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tac1P41539 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tac1P41539 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tac1P41539 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Tac1P41539 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Tac1P41539 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tac1P41539 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Tac1P41539 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tac1P41539 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tac1P41539 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Tac1P41539 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tac1P41539 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tac1P41539 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tac1P41539 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tac1P41539 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tac1P41539 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tac1P41539 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tac1P41539 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tac1P41539 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tac1P41539 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tac1P41539 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tac1P41539 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tac1P41539 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tac1P41539 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tac1P41539 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tac1P41539 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tac1P41539 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tac1P41539 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tac1P41539 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Tac1P41539 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tac1P41539 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tac1P41539 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Tac1P41539 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Tac1P41539 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Tac1P41539 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Tac1P41539 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Tac1P41539 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Tac1P41539 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tac1P41539 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tac1P41539 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tac1P41539 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tac1P41539 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tac1P41539 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tac1P41539 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tac1P41539 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Tac1P41539 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tac1P41539 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tac1P41539 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tac1P41539 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tac1P41539 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tac1P41539 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tac1P41539 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.2 ms