Protein–RNA interactions for Protein: P41155

Ltb, Lymphotoxin-beta, mousemouse

Predictions only

Length 306 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LtbP41155 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
LtbP41155 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
LtbP41155 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
LtbP41155 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
LtbP41155 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
LtbP41155 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
LtbP41155 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
LtbP41155 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
LtbP41155 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
LtbP41155 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
LtbP41155 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
LtbP41155 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
LtbP41155 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
LtbP41155 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
LtbP41155 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
LtbP41155 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
LtbP41155 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
LtbP41155 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
LtbP41155 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
LtbP41155 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
LtbP41155 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
LtbP41155 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
LtbP41155 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
LtbP41155 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
LtbP41155 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
LtbP41155 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
LtbP41155 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
LtbP41155 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
LtbP41155 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
LtbP41155 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
LtbP41155 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
LtbP41155 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
LtbP41155 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC14.46□□□□□ -0.09
LtbP41155 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC14.46□□□□□ -0.09
LtbP41155 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
LtbP41155 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
LtbP41155 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
LtbP41155 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
LtbP41155 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
LtbP41155 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
LtbP41155 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
LtbP41155 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC14.46□□□□□ -0.09
LtbP41155 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
LtbP41155 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
LtbP41155 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
LtbP41155 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
LtbP41155 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
LtbP41155 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
LtbP41155 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
LtbP41155 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
LtbP41155 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC14.46□□□□□ -0.09
LtbP41155 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.1
LtbP41155 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.46□□□□□ -0.1
LtbP41155 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
LtbP41155 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
LtbP41155 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.1
LtbP41155 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
LtbP41155 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
LtbP41155 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
LtbP41155 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
LtbP41155 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
LtbP41155 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
LtbP41155 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
LtbP41155 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
LtbP41155 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
LtbP41155 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
LtbP41155 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC14.45□□□□□ -0.1
LtbP41155 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
LtbP41155 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
LtbP41155 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
LtbP41155 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
LtbP41155 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
LtbP41155 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
LtbP41155 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
LtbP41155 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
LtbP41155 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
LtbP41155 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
LtbP41155 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
LtbP41155 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
LtbP41155 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
LtbP41155 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
LtbP41155 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
LtbP41155 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
LtbP41155 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
LtbP41155 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
LtbP41155 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
LtbP41155 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
LtbP41155 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
LtbP41155 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
LtbP41155 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
LtbP41155 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
LtbP41155 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
LtbP41155 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
LtbP41155 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
LtbP41155 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
LtbP41155 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
LtbP41155 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
LtbP41155 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC14.44□□□□□ -0.1
LtbP41155 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
LtbP41155 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.4 ms