Protein–RNA interactions for Protein: P41105

Rpl28, 60S ribosomal protein L28, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 137 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl28P41105 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rpl28P41105 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rpl28P41105 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rpl28P41105 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rpl28P41105 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rpl28P41105 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rpl28P41105 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rpl28P41105 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rpl28P41105 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Rpl28P41105 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rpl28P41105 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rpl28P41105 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rpl28P41105 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rpl28P41105 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rpl28P41105 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rpl28P41105 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rpl28P41105 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rpl28P41105 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rpl28P41105 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rpl28P41105 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rpl28P41105 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rpl28P41105 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rpl28P41105 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rpl28P41105 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rpl28P41105 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Rpl28P41105 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rpl28P41105 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rpl28P41105 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rpl28P41105 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rpl28P41105 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rpl28P41105 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rpl28P41105 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rpl28P41105 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rpl28P41105 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rpl28P41105 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rpl28P41105 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rpl28P41105 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rpl28P41105 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rpl28P41105 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rpl28P41105 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rpl28P41105 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rpl28P41105 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rpl28P41105 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rpl28P41105 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rpl28P41105 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rpl28P41105 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rpl28P41105 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rpl28P41105 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rpl28P41105 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rpl28P41105 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rpl28P41105 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rpl28P41105 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rpl28P41105 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rpl28P41105 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rpl28P41105 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rpl28P41105 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rpl28P41105 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rpl28P41105 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rpl28P41105 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rpl28P41105 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rpl28P41105 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rpl28P41105 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rpl28P41105 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rpl28P41105 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rpl28P41105 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rpl28P41105 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rpl28P41105 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rpl28P41105 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rpl28P41105 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rpl28P41105 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rpl28P41105 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Rpl28P41105 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Rpl28P41105 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.6
Rpl28P41105 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Rpl28P41105 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Rpl28P41105 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Rpl28P41105 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Rpl28P41105 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Rpl28P41105 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Rpl28P41105 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Rpl28P41105 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Rpl28P41105 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Rpl28P41105 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Rpl28P41105 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Rpl28P41105 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Rpl28P41105 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Rpl28P41105 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Rpl28P41105 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Rpl28P41105 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Rpl28P41105 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Rpl28P41105 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Rpl28P41105 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Rpl28P41105 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Rpl28P41105 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Rpl28P41105 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Rpl28P41105 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Rpl28P41105 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Rpl28P41105 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Rpl28P41105 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Rpl28P41105 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
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