Protein–RNA interactions for Protein: P40630

Tfam, Transcription factor A, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 243 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TfamP40630 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TfamP40630 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TfamP40630 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TfamP40630 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TfamP40630 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TfamP40630 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TfamP40630 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TfamP40630 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TfamP40630 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TfamP40630 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TfamP40630 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TfamP40630 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TfamP40630 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TfamP40630 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TfamP40630 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TfamP40630 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
TfamP40630 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TfamP40630 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TfamP40630 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TfamP40630 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TfamP40630 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TfamP40630 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TfamP40630 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TfamP40630 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TfamP40630 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TfamP40630 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TfamP40630 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TfamP40630 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TfamP40630 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TfamP40630 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TfamP40630 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TfamP40630 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TfamP40630 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TfamP40630 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TfamP40630 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TfamP40630 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TfamP40630 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TfamP40630 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TfamP40630 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TfamP40630 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TfamP40630 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
TfamP40630 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TfamP40630 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TfamP40630 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TfamP40630 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TfamP40630 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TfamP40630 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TfamP40630 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TfamP40630 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TfamP40630 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TfamP40630 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TfamP40630 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TfamP40630 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
TfamP40630 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TfamP40630 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TfamP40630 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TfamP40630 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TfamP40630 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TfamP40630 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TfamP40630 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TfamP40630 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TfamP40630 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TfamP40630 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TfamP40630 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TfamP40630 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TfamP40630 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TfamP40630 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TfamP40630 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TfamP40630 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
TfamP40630 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TfamP40630 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TfamP40630 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TfamP40630 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TfamP40630 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TfamP40630 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TfamP40630 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TfamP40630 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TfamP40630 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TfamP40630 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TfamP40630 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
TfamP40630 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TfamP40630 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
TfamP40630 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TfamP40630 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TfamP40630 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TfamP40630 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TfamP40630 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TfamP40630 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TfamP40630 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TfamP40630 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TfamP40630 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TfamP40630 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TfamP40630 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TfamP40630 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TfamP40630 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TfamP40630 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TfamP40630 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TfamP40630 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TfamP40630 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TfamP40630 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.5 ms