Protein–RNA interactions for Protein: P40240

Cd9, CD9 antigen, mousemouse

Predictions only

Length 226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd9P40240 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cd9P40240 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Cd9P40240 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cd9P40240 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cd9P40240 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cd9P40240 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Cd9P40240 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Cd9P40240 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Cd9P40240 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Cd9P40240 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Cd9P40240 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Cd9P40240 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Cd9P40240 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cd9P40240 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cd9P40240 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cd9P40240 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cd9P40240 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cd9P40240 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cd9P40240 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cd9P40240 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cd9P40240 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cd9P40240 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cd9P40240 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cd9P40240 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cd9P40240 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cd9P40240 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Cd9P40240 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cd9P40240 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Cd9P40240 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cd9P40240 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Cd9P40240 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cd9P40240 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cd9P40240 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cd9P40240 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cd9P40240 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cd9P40240 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cd9P40240 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cd9P40240 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cd9P40240 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cd9P40240 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cd9P40240 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cd9P40240 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cd9P40240 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cd9P40240 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cd9P40240 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cd9P40240 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cd9P40240 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cd9P40240 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cd9P40240 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cd9P40240 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cd9P40240 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cd9P40240 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Cd9P40240 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cd9P40240 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Cd9P40240 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cd9P40240 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cd9P40240 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Cd9P40240 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cd9P40240 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cd9P40240 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cd9P40240 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cd9P40240 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cd9P40240 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cd9P40240 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cd9P40240 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cd9P40240 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cd9P40240 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cd9P40240 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cd9P40240 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cd9P40240 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cd9P40240 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cd9P40240 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cd9P40240 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cd9P40240 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cd9P40240 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cd9P40240 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cd9P40240 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cd9P40240 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Cd9P40240 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cd9P40240 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Cd9P40240 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cd9P40240 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cd9P40240 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cd9P40240 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cd9P40240 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cd9P40240 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cd9P40240 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cd9P40240 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cd9P40240 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cd9P40240 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cd9P40240 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cd9P40240 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cd9P40240 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cd9P40240 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cd9P40240 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cd9P40240 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cd9P40240 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cd9P40240 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cd9P40240 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cd9P40240 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.4 ms