Protein–RNA interactions for Protein: P39087

Grik2, Glutamate receptor ionotropic, kainate 2, mousemouse

Predictions only

Length 908 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grik2P39087 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Grik2P39087 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
Grik2P39087 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Grik2P39087 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Grik2P39087 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Grik2P39087 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Grik2P39087 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Grik2P39087 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Grik2P39087 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Grik2P39087 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Grik2P39087 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Grik2P39087 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Grik2P39087 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Grik2P39087 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Grik2P39087 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Grik2P39087 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Grik2P39087 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Grik2P39087 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Grik2P39087 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Grik2P39087 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Grik2P39087 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Grik2P39087 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Grik2P39087 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Grik2P39087 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Grik2P39087 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Grik2P39087 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Grik2P39087 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Grik2P39087 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Grik2P39087 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Grik2P39087 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Grik2P39087 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Grik2P39087 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Grik2P39087 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Grik2P39087 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Grik2P39087 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Grik2P39087 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Grik2P39087 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Grik2P39087 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Grik2P39087 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Grik2P39087 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Grik2P39087 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Grik2P39087 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Grik2P39087 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Grik2P39087 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Grik2P39087 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Grik2P39087 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Grik2P39087 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Grik2P39087 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Grik2P39087 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Grik2P39087 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Grik2P39087 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Grik2P39087 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Grik2P39087 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Grik2P39087 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Grik2P39087 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Grik2P39087 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Grik2P39087 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Grik2P39087 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Grik2P39087 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Grik2P39087 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Grik2P39087 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Grik2P39087 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Grik2P39087 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Grik2P39087 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Grik2P39087 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Grik2P39087 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Grik2P39087 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Grik2P39087 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Grik2P39087 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Grik2P39087 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Grik2P39087 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Grik2P39087 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Grik2P39087 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Grik2P39087 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Grik2P39087 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Grik2P39087 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Grik2P39087 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Grik2P39087 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Grik2P39087 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Grik2P39087 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Grik2P39087 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Grik2P39087 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Grik2P39087 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Grik2P39087 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Grik2P39087 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Grik2P39087 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Grik2P39087 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Grik2P39087 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Grik2P39087 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Grik2P39087 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Grik2P39087 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Grik2P39087 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Grik2P39087 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Grik2P39087 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Grik2P39087 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Grik2P39087 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Grik2P39087 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Grik2P39087 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Grik2P39087 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Grik2P39087 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28 ms