Protein–RNA interactions for Protein: P38585

Ttl, Tubulin--tyrosine ligase, mousemouse

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Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TtlP38585 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TtlP38585 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TtlP38585 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TtlP38585 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TtlP38585 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TtlP38585 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TtlP38585 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TtlP38585 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TtlP38585 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TtlP38585 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TtlP38585 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TtlP38585 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TtlP38585 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TtlP38585 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TtlP38585 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TtlP38585 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TtlP38585 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TtlP38585 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TtlP38585 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TtlP38585 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TtlP38585 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TtlP38585 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TtlP38585 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
TtlP38585 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TtlP38585 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TtlP38585 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TtlP38585 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TtlP38585 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
TtlP38585 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
TtlP38585 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TtlP38585 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TtlP38585 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TtlP38585 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TtlP38585 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TtlP38585 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TtlP38585 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TtlP38585 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TtlP38585 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TtlP38585 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TtlP38585 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TtlP38585 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TtlP38585 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TtlP38585 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
TtlP38585 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TtlP38585 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TtlP38585 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TtlP38585 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TtlP38585 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TtlP38585 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TtlP38585 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TtlP38585 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TtlP38585 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TtlP38585 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TtlP38585 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TtlP38585 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TtlP38585 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TtlP38585 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TtlP38585 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TtlP38585 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TtlP38585 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TtlP38585 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TtlP38585 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TtlP38585 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TtlP38585 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
TtlP38585 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
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TtlP38585 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TtlP38585 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TtlP38585 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TtlP38585 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TtlP38585 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TtlP38585 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TtlP38585 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TtlP38585 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TtlP38585 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TtlP38585 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
TtlP38585 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TtlP38585 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TtlP38585 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TtlP38585 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TtlP38585 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TtlP38585 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TtlP38585 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TtlP38585 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TtlP38585 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
TtlP38585 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TtlP38585 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TtlP38585 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TtlP38585 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
TtlP38585 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TtlP38585 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
TtlP38585 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TtlP38585 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TtlP38585 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TtlP38585 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TtlP38585 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
TtlP38585 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TtlP38585 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms