Protein–RNA interactions for Protein: P38575

Upk2, Uroplakin-2, mousemouse

Predictions only

Length 184 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Upk2P38575 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Upk2P38575 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Upk2P38575 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Upk2P38575 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Upk2P38575 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Upk2P38575 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Upk2P38575 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Upk2P38575 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Upk2P38575 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Upk2P38575 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Upk2P38575 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Upk2P38575 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Upk2P38575 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Upk2P38575 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Upk2P38575 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Upk2P38575 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Upk2P38575 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Upk2P38575 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Upk2P38575 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Upk2P38575 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Upk2P38575 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Upk2P38575 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Upk2P38575 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Upk2P38575 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Upk2P38575 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Upk2P38575 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Upk2P38575 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Upk2P38575 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Upk2P38575 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Upk2P38575 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Upk2P38575 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Upk2P38575 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Upk2P38575 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Upk2P38575 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Upk2P38575 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Upk2P38575 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Upk2P38575 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Upk2P38575 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Upk2P38575 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Upk2P38575 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Upk2P38575 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Upk2P38575 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Upk2P38575 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Upk2P38575 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Upk2P38575 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Upk2P38575 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Upk2P38575 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Upk2P38575 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Upk2P38575 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Upk2P38575 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Upk2P38575 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Upk2P38575 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Upk2P38575 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Upk2P38575 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Upk2P38575 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Upk2P38575 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Upk2P38575 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Upk2P38575 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Upk2P38575 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Upk2P38575 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Upk2P38575 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Upk2P38575 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Upk2P38575 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Upk2P38575 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Upk2P38575 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Upk2P38575 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Upk2P38575 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Upk2P38575 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Upk2P38575 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Upk2P38575 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Upk2P38575 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Upk2P38575 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Upk2P38575 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Upk2P38575 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Upk2P38575 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Upk2P38575 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Upk2P38575 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Upk2P38575 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Upk2P38575 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Upk2P38575 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Upk2P38575 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Upk2P38575 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Upk2P38575 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Upk2P38575 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Upk2P38575 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Upk2P38575 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Upk2P38575 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Upk2P38575 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Upk2P38575 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Upk2P38575 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Upk2P38575 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Upk2P38575 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Upk2P38575 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Upk2P38575 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Upk2P38575 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Upk2P38575 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Upk2P38575 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Upk2P38575 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Upk2P38575 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Upk2P38575 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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