Protein–RNA interactions for Protein: P35821

Ptpn1, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 1, mousemouse

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptpn1P35821 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ptpn1P35821 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ptpn1P35821 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ptpn1P35821 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ptpn1P35821 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ptpn1P35821 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ptpn1P35821 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ptpn1P35821 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ptpn1P35821 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ptpn1P35821 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ptpn1P35821 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ptpn1P35821 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ptpn1P35821 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ptpn1P35821 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ptpn1P35821 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ptpn1P35821 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Ptpn1P35821 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Ptpn1P35821 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ptpn1P35821 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ptpn1P35821 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ptpn1P35821 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Ptpn1P35821 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ptpn1P35821 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Ptpn1P35821 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ptpn1P35821 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ptpn1P35821 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Ptpn1P35821 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ptpn1P35821 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ptpn1P35821 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ptpn1P35821 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ptpn1P35821 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ptpn1P35821 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ptpn1P35821 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ptpn1P35821 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ptpn1P35821 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ptpn1P35821 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Ptpn1P35821 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Ptpn1P35821 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Ptpn1P35821 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Ptpn1P35821 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Ptpn1P35821 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Ptpn1P35821 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Ptpn1P35821 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Ptpn1P35821 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Ptpn1P35821 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Ptpn1P35821 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Ptpn1P35821 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Ptpn1P35821 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ptpn1P35821 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ptpn1P35821 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ptpn1P35821 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ptpn1P35821 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ptpn1P35821 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ptpn1P35821 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ptpn1P35821 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ptpn1P35821 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ptpn1P35821 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ptpn1P35821 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Ptpn1P35821 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ptpn1P35821 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ptpn1P35821 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ptpn1P35821 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ptpn1P35821 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ptpn1P35821 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ptpn1P35821 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ptpn1P35821 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ptpn1P35821 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Ptpn1P35821 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ptpn1P35821 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ptpn1P35821 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ptpn1P35821 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ptpn1P35821 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ptpn1P35821 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ptpn1P35821 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ptpn1P35821 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ptpn1P35821 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Ptpn1P35821 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ptpn1P35821 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ptpn1P35821 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ptpn1P35821 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ptpn1P35821 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ptpn1P35821 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ptpn1P35821 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ptpn1P35821 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ptpn1P35821 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ptpn1P35821 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ptpn1P35821 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ptpn1P35821 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ptpn1P35821 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ptpn1P35821 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ptpn1P35821 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ptpn1P35821 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ptpn1P35821 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ptpn1P35821 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ptpn1P35821 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ptpn1P35821 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ptpn1P35821 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ptpn1P35821 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ptpn1P35821 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ptpn1P35821 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.7 ms