Protein–RNA interactions for Protein: P35459

Ly6d, Lymphocyte antigen 6D, mousemouse

Predictions only

Length 127 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ly6dP35459 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ly6dP35459 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ly6dP35459 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ly6dP35459 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ly6dP35459 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ly6dP35459 Med10-204ENSMUST00000221893 815 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ly6dP35459 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Ly6dP35459 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ly6dP35459 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ly6dP35459 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ly6dP35459 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ly6dP35459 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ly6dP35459 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ly6dP35459 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ly6dP35459 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ly6dP35459 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ly6dP35459 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Ly6dP35459 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ly6dP35459 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ly6dP35459 Gm26935-201ENSMUST00000182686 519 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ly6dP35459 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Ly6dP35459 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ly6dP35459 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ly6dP35459 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ly6dP35459 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Ly6dP35459 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ly6dP35459 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ly6dP35459 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ly6dP35459 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ly6dP35459 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ly6dP35459 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ly6dP35459 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ly6dP35459 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ly6dP35459 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ly6dP35459 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ly6dP35459 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ly6dP35459 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Ly6dP35459 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ly6dP35459 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ly6dP35459 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Ly6dP35459 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Ly6dP35459 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ly6dP35459 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ly6dP35459 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ly6dP35459 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ly6dP35459 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ly6dP35459 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ly6dP35459 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ly6dP35459 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ly6dP35459 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ly6dP35459 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ly6dP35459 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ly6dP35459 Pou2f3-rs1-201ENSMUST00000120271 1046 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Ly6dP35459 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ly6dP35459 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ly6dP35459 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ly6dP35459 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ly6dP35459 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ly6dP35459 9230110C19Rik-202ENSMUST00000215478 533 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ly6dP35459 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ly6dP35459 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ly6dP35459 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ly6dP35459 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ly6dP35459 Gm10322-201ENSMUST00000095646 336 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ly6dP35459 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ly6dP35459 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ly6dP35459 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ly6dP35459 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ly6dP35459 Lcn5-202ENSMUST00000100312 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ly6dP35459 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ly6dP35459 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ly6dP35459 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ly6dP35459 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ly6dP35459 Gm11724-201ENSMUST00000125577 472 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ly6dP35459 Vps53-204ENSMUST00000129256 650 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ly6dP35459 Gpx4-207ENSMUST00000183037 735 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ly6dP35459 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Ly6dP35459 Ino80e-214ENSMUST00000206349 883 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ly6dP35459 Gm39228-201ENSMUST00000212456 301 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ly6dP35459 Lamtor1-201ENSMUST00000033131 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ly6dP35459 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ly6dP35459 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ly6dP35459 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ly6dP35459 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ly6dP35459 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ly6dP35459 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ly6dP35459 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ly6dP35459 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ly6dP35459 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ly6dP35459 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ly6dP35459 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ly6dP35459 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ly6dP35459 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ly6dP35459 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Ly6dP35459 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ly6dP35459 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ly6dP35459 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ly6dP35459 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ly6dP35459 Gm31105-201ENSMUST00000211421 687 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ly6dP35459 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.9 ms