Protein–RNA interactions for Protein: P35441

Thbs1, Thrombospondin-1, mousemouse

Predictions only

Length 1,170 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Thbs1P35441 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
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Thbs1P35441 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
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Thbs1P35441 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Thbs1P35441 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Thbs1P35441 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Thbs1P35441 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Thbs1P35441 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Thbs1P35441 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Thbs1P35441 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Thbs1P35441 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Thbs1P35441 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Thbs1P35441 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Thbs1P35441 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Thbs1P35441 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Thbs1P35441 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Thbs1P35441 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Thbs1P35441 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Thbs1P35441 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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Thbs1P35441 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Thbs1P35441 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Thbs1P35441 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Thbs1P35441 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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Thbs1P35441 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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Thbs1P35441 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Thbs1P35441 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Thbs1P35441 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Thbs1P35441 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Thbs1P35441 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Thbs1P35441 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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Thbs1P35441 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Thbs1P35441 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Thbs1P35441 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Thbs1P35441 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
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Thbs1P35441 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Thbs1P35441 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Thbs1P35441 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
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Thbs1P35441 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Thbs1P35441 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Thbs1P35441 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
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Thbs1P35441 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
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Thbs1P35441 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Thbs1P35441 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Thbs1P35441 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Thbs1P35441 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
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Thbs1P35441 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
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Thbs1P35441 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Thbs1P35441 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Thbs1P35441 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Thbs1P35441 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Thbs1P35441 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Thbs1P35441 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Thbs1P35441 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Thbs1P35441 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Thbs1P35441 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Thbs1P35441 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Thbs1P35441 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Thbs1P35441 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Thbs1P35441 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Thbs1P35441 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Thbs1P35441 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Thbs1P35441 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Thbs1P35441 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Thbs1P35441 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
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